松属GAs相关ESTSSR标记与火炬松×洪都拉斯加勒比松苗高相关性分析

doi:10.3969/j.jssn.1000-2006.2011.01.002

国家林草科技领军期刊
中国精品科技期刊
中国高校百佳科技期刊
江苏省新闻出版政府奖期刊奖
RCCSE林学权威期刊（A+）
CSCD核心期刊
Scopus数据库收录期刊
中文核心期刊
SCD核心期刊

作者加群：102861116

微信公众号：南京林业大学学报

高级检索

南京林业大学学报（自然科学版） ›› 2011, Vol. 35 ›› Issue (01): 6-10.doi: 10.3969/j.jssn.1000-2006.2011.01.002

松属GAs相关ESTSSR标记与火炬松×洪都拉斯加勒比松苗高相关性分析

栾启福，姜景民，张守攻

1. 中国林业科学研究院亚热带林业研究所，浙江富阳311400；2. 中国林业科学研究院林业研究所,北京100091

出版日期:2011-01-14 发布日期:2011-01-14
基金资助:
收稿日期：2010-05-26修回日期：2010-11-06基金项目：浙江省科技计划项目（2008C32015）；国家农业科技成果转化资金项目（2009GB24320476）作者简介：栾启福（1976—），助理研究员，博士。*姜景民（通信作者），研究员。Email:Jmjiang6001@126.com。

Analysis on correlation of ESTSSR markers relating to GAs metabolism for Pinus L. with the seedling height of Pinus taeda×P. caribaea var. hondurensis

LUAN Qifu, JIANG Jingmin, ZHANG Shougong

1. Research Institute of Subtropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, Fuyang 311400,China；2. Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Beijing 100091,China

Online:2011-01-14 Published:2011-01-14

摘要/Abstract

摘要： 以火炬松×洪都拉斯加勒比松F1代群体为研究对象，从松树PGI（松类基因索引）数据中筛选出13个与赤霉素（GAs）代谢有关的序列。设计了这13条序列的ESTSSR引物对，并筛选出4对引物作为F1代检测的较好的标记。4对引物PCR分析显示在2个亲本和39个子代中共扩增出1 014个多态性位点，其中，杂种F1代扩增出的位点数中有50.19 %与父本相同，5217 %与母本相同，这表明母本（火炬松）和父本（加勒比松）杂交能够得到获得双亲遗传物质的新杂种。4个引物检测的26个等位基因位点中有6个与苗龄6个月的苗高有显著或极显著的相关性，有5个位点与苗龄9个月的苗高有显著或极显著相关性。这为早期选择提供了较好的分子标记。

Abstract: Thirteen ESTSSR molecular markers related to GAs metabolism for Pinus L. were developed from EST sequences in PGI（Pinus gene index）database. 1 014 alleles were amplified with two parents and 39 F1 progeny of Pinus taeda×P. caribaea var. hondurensis with four primerpairs, which were selected from the thirteen ESTSSRs. 5019 % of the 1 014 alleles were originated from the male parent（P. taeda） and 5217 % were shared with the female parent（P. caribaea var. hondurensis）, which showed that the progeny of this hybridization inherent genetic materials from both parents. Six locus selected from all 26 locus amplified by four primer pairs were related significantly to sixmonth old seedling height of the 39 F1 hybrids, and five locus related significantly to ninemonth old seedling height. Therefore, this markers can serve as good molecular markers for early selection.

中图分类号:

S722.3+4

栾启福,姜景民,张守攻. 松属GAs相关ESTSSR标记与火炬松×洪都拉斯加勒比松苗高相关性分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2011, 35(01): 6-10.

LUAN Qifu, JIANG Jingmin, ZHANG Shougong. Analysis on correlation of ESTSSR markers relating to GAs metabolism for Pinus L. with the seedling height of Pinus taeda×P. caribaea var. hondurensis[J].Journal of Nanjing Forestry University (Natural Science Edition), 2011, 35(01): 6-10.DOI: 10.3969/j.jssn.1000-2006.2011.01.002.

参考文献

[1]潘志刚. 湿地松、火炬松种源试验研究[M]. 北京：北京科技出版社, 1992.
[2]潘志刚. 15年生火炬松种源试验研究初报[J]. 林业科学，2000, 36（专刊1）：70-79.
[3]赵奋成, 李宪政, 张应中,等. 湿地松与洪都拉斯加勒比松的杂交效果分析[J].林业科学研究，2006,19(4): 409-415.
[4]栾启福，姜景民，张建忠，等. 国外松种间杂交育种及其F1代早期生长评价[J]．林业科学研究，2008,21(3):314-319.
[5]栾启福，姜景民，张建忠，等．不同松树杂种F1代在浙北和皖南的生长差异及其早期评选[J]. 林业科学研究，2010,23 (1): 25-30.
[6]Komulainen P，Brown G R，Mikkonen M，et a1．Comparing ESTbased genetic maps between Pinus sylvestris and Pinus taeda [J]. Theor Appl Genet，2003，107（4）：667- 678.
[7]李虹，卢孟柱，蒋湘宁. 表达序列标签(EST)分析及其在林木研究中的应用[J]. 林业科学研究，2004，17(6)：804-809.
[8]金基强，崔海瑞，陈文乐，等. 茶树ESTSSR的信息分析与标记建立[J]. 茶叶科学，2006，26（1）:17-23.
[9]Cato S A，Gardener R C，Kent J，et a1. A rapid PCRbased method for genetically mapping ESTs[J]. Theor Appl Genet，2001，102（2-3）：296-306.
[10]Temesgen B，Brown G R，Harry D E，et a1．Genetic mapping of expressed sequence tag poly anorphism(ESTP) markers in loblolly pine (Pinus taeda L.)[J]. Theor Appl Genet，2001，102（5）：664-675.
[11]Brown G R，Kadel III E E，Bassoni D L，et a1．Anchored Reference Loci in Loblolly Pine(Pinus taeda L．)for Integrating Pine Genomics [J]. Genetics, 2001,159: 799-809.
[12]李华盛，范术丽，沈法富．从棉花ESTs数据库中筛选微卫星标记的初步研究[J].棉花学报，2005，17(4)：211-216.
[13]Zhu Y,King B L,Parvizi B,et al.TIGR gene indices clustering tools(TGICL):a software system for fast clustering of large EST datasets[J].Bioinformatics,2003,19(5):651-652.
[14]张一,周志春,金国庆,等. 马尾松双列杂交亲本遗传距离与杂种生长优势相关性分析[J]. 南京林业大学学报:自然科学版,2010,34(1):9-14.
[15]张一,储德裕, 金国庆,等.马尾松1代育种群体遗传多样性的ISSR分析[J]. 林业科学研究，2009,22(6):772- 778.
[16]王秀莉, 姚颖垠, 彭惠茹, 等. 赤霉素代谢及其调控相关基因的差异表达与小麦株高杂种优势的关系研究[J]. 科学通报, 2009, 54(16):2320-2324.
[17]Nei M.Genetic distance between populations[J]. Am Nat:the American Naturalist,1972,106:283-292.
[18]Soper H E,Yong A W,Care B M,et al. On the distribution of the correlation coefficient in small samples.Appendix Ⅱ to the papers of “Student” and R A Fisher: A cooperation study[J]. Biometrika,1971,11:328-413.
[19]张晶,吴锁伟,刘秉华,等. 黄淮冬麦区小麦冬、春性改良及分子标记辅助选择技术初探[J].作物学报，2010,36(3): 385-390.
[20]李文滨,赵雪. 2009年大豆分子标记及辅助选择育种研究进展[J]. 东北农业大学学报,2010, 41(1): 139-148.

松属GAs相关ESTSSR标记与火炬松×洪都拉斯加勒比松苗高相关性分析

Analysis on correlation of ESTSSR markers relating to GAs metabolism for Pinus L. with the seedling height of Pinus taeda×P. caribaea var. hondurensis

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 0

编辑推荐

Metrics

本文评价

作者

读者

审稿