南京林业大学学报(自然科学版) ›› 2024, Vol. 48 ›› Issue (4): 12-24.doi: 10.12302/j.issn.1000-2006.202405026
所属专题: 专题报道Ⅰ:郑万钧先生诞辰120周年纪念专题Ⅱ
• 专题报道Ⅰ:郑万钧先生诞辰120周年纪念专题Ⅱ(执行主编 曹福亮、尹佟明、李维林、方升佐) • 上一篇 下一篇
王一涵1(), 刘姣姣1, 金沛权1, 李书情1, 魏建芬2, 郭朋1, 尚富德1,*()
收稿日期:
2024-05-15
修回日期:
2024-06-07
出版日期:
2024-07-30
发布日期:
2024-08-05
通讯作者:
*尚富德(shangfude@henau.edu.cn),教授。作者简介:
王一涵(yihanwang@vip.163.com),副教授。
基金资助:
WANG Yihan1(), LIU Jiaojiao1, JIN Peiquan1, LI Shuqing1, WEI Jianfen2, GUO Peng1, SHANG Fude1,*()
Received:
2024-05-15
Revised:
2024-06-07
Online:
2024-07-30
Published:
2024-08-05
摘要:
【目的】筛选核心单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,建立基于KASP平台的桂花(Osmanthus fragrans)品种基因型快速检测方法,构建品种特异性分子身份证,为桂花品种鉴定、溯源、知识产权保护等提供理论基础。【方法】实地调查主流桂花栽培品种的重要表型特征。通过两轮严格筛选,从基因组SNP中保留一组能够完全鉴别测序品种的最优SNP标记,计算SNP 位点的多态信息含量(PIC)、期望杂合度(He)等信息。以‘日香桂’(‘Rixianggui’)基因组为参考,设计桂花特异性KASP引物并进行批量扩增,根据基因分型结果建立品种指纹图谱,评估核心SNP标记的品种鉴别力。结合品种表型信息码和品种分子指纹码构建桂花品种资源的分子身份证。【结果】筛选出14个能够完全鉴别测序品种的核心SNP位点。各位点PIC值的变化范围为0.246~0.375,平均值为0.335;He的变化范围为 0.288~0.500,平均值为0.431。针对核心位点设计的KASP引物基因分型准确。根据扩增结果构建DNA指纹图谱,可区分全部包括未测序品种在内的90个参试品种。对品种表型特征赋值,结合指纹码构建由34位数字组成的桂花品种资源分子身份证。【结论】确定了SNP1—SNP14共14个核心SNP位点,能够实现至少90个桂花品种的有效鉴别。结合品种群类型、表型特征和分子指纹码构建了90个桂花品种的唯一分子身份证,并生成对应的条形码和二维码。
中图分类号:
王一涵,刘姣姣,金沛权,等. 基于表型性状和SNP标记构建桂花主要品种资源的分子身份证[J]. 南京林业大学学报(自然科学版), 2024, 48(4): 12-24.
WANG Yihan, LIU Jiaojiao, JIN Peiquan, LI Shuqing, WEI Jianfen, GUO Peng, SHANG Fude. Construction of molecular ID for Osmanthus fragrans cultivars based on phenotypic traits and single nucleotide polymorphisms (SNPs)[J].Journal of Nanjing Forestry University (Natural Science Edition), 2024, 48(4): 12-24.DOI: 10.12302/j.issn.1000-2006.202405026.
附表1
90份供试桂花种质资源信息"
编号 No. | 采样地点 sampling sites | 品种名称 cultivar name | 品种群 cultivar group | 英国皇家园艺 学会比色卡 比值 RHSCC | 花色 flower color | 花香 floral fragrance | 新梢顶芽和 腋芽总数 number of terminal and axillary buds per shoot | 每花序 小花数量 number of flowers per inflorescence | 结实性 fertility |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 河南省信阳市潢川金桂园 | 橙香丹桂 | 丹桂 | 23A | 橙 | 微香 | 18.00 | 6.44 | 否 |
2 | 河南省信阳市潢川金桂园 | 潢川金桂 | 金桂 | 10B | 黄 | 中香 | 21.14 | 6.28 | 是 |
3 | 河南省开封市河南大学金明校区 | 鄂橙 | 丹桂 | N25B | 橙 | 中香 | 22.11 | 5.89 | 否 |
4 | 河南省开封市河南大学金明校区 | 娇容 | 丹桂 | 23A | 橙 | 中香 | 15.33 | 4.89 | 否 |
5 | 河南省开封市河南大学金明校区 | 象山丹桂 | 丹桂 | N25B | 橙 | 浓香 | 21.56 | 5.00 | 是 |
6 | 河南省开封市河南大学金明校区 | 金狮桂 | 金桂 | 6C | 黄 | 中香 | 23.00 | 7.00 | 否 |
7 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 齿丹桂 | 丹桂 | 25B | 橙 | 微香 | 11.44 | 5.11 | 否 |
8 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 橙红丹桂 | 丹桂 | 28A | 橙 | 中香 | 13.56 | 6.11 | 是 |
9 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 红桂 | 丹桂 | 25A | 橙 | 中香 | 22.33 | 6.78 | 是 |
10 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 火炼金丹 | 丹桂 | 29A | 橙 | 微香 | 14.22 | 6.89 | 否 |
11 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 莲籽丹桂 | 丹桂 | 25B | 橙 | 微香 | 21.56 | 6.11 | 否 |
12 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 满条红 | 丹桂 | N25B | 橙 | 中香 | 11.00 | 6.89 | 否 |
13 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 平脉丹桂 | 丹桂 | N25B | 橙 | 中香 | 12.22 | 6.56 | 否 |
14 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 软叶丹桂 | 丹桂 | 24A | 橙 | 中香 | 9.44 | 4.89 | 否 |
15 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 上海丹桂 | 丹桂 | 23A | 橙 | 中香 | 20.33 | 5.89 | 否 |
16 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 桃叶丹桂 | 丹桂 | 23A | 橙 | 中香 | 8.22 | 9.44 | 否 |
17 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 晚霞 | 丹桂 | 25A | 橙 | 中香 | 14.00 | 6.22 | 否 |
18 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 武夷丹桂 | 丹桂 | 25A | 橙 | 微香 | 20.11 | 6.11 | 否 |
19 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 雄黄桂 | 丹桂 | 26A | 橙 | 微香 | 11.67 | 6.56 | 否 |
20 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 小叶丹桂 | 丹桂 | 24A | 橙 | 中香 | 26.00 | 8.33 | 否 |
21 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 堰虹桂 | 丹桂 | 25A | 橙 | 中香 | 13.33 | 6.00 | 否 |
22 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 硬叶丹桂 | 丹桂 | 23B | 橙 | 中香 | 23.33 | 5.89 | 否 |
23 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 醉肌红 | 丹桂 | 25B | 橙 | 中香 | 22.11 | 5.33 | 否 |
24 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 朱砂丹桂 | 丹桂 | 25A | 橙 | 微香 | 31.11 | 5.89 | 否 |
25 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 状元红 | 丹桂 | 28B | 橙 | 中香 | 11.33 | 5.11 | 否 |
26 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 编金桂 | 金桂 | 10A | 黄 | 浓香 | 10.00 | 6.22 | 否 |
27 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 长瓣金桂 | 金桂 | 14C | 黄 | 中香 | 11.00 | 6.33 | 否 |
28 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 长柄金桂 | 金桂 | 12D | 白 | 中香 | 20.44 | 6.56 | 否 |
29 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 丛中笑 | 金桂 | 13C | 黄 | 中香 | 22.33 | 8.00 | 是 |
30 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 大花金桂 | 金桂 | 12C | 黄 | 浓香 | 20.22 | 5.11 | 否 |
31 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 大叶黄 | 金桂 | 11B | 黄 | 浓香 | 7.89 | 5.00 | 否 |
32 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 大叶金桂 | 金桂 | 11C | 黄 | 浓香 | 24.67 | 8.56 | 是 |
33 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 芙蓉桂 | 金桂 | 3C | 黄 | 中香 | 31.44 | 6.00 | 否 |
34 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 杭州黄 | 金桂 | 2D | 黄 | 中香 | 9.22 | 4.89 | 否 |
35 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 黑珍珠 | 金桂 | 2D | 黄 | 微香 | 22.00 | 6.44 | 否 |
36 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 金桂河边 | 金桂 | 7A | 黄 | 中香 | 20.11 | 5.89 | 否 |
37 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 金球桂 | 金桂 | 4C | 黄 | 中香 | 37.89 | 6.00 | 否 |
38 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 金秋早 | 金桂 | 1C | 白 | 中香 | 32.56 | 6.33 | 否 |
39 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 镰叶金桂 | 金桂 | 1D | 黄 | 微香 | 39.33 | 6.22 | 否 |
40 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 柳叶黄 | 金桂 | 4C | 黄 | 中香 | 13.11 | 6.00 | 否 |
41 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 柳叶金桂 | 金桂 | 10A | 黄 | 中香 | 25.00 | 4.89 | 否 |
42 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 柳叶苏桂 | 金桂 | 5C | 黄 | 浓香 | 33.00 | 8.56 | 否 |
43 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 漓锗金桂 | 金桂 | 11A | 黄 | 中香 | 10.33 | 8.11 | 否 |
44 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 球桂 | 金桂 | 7D | 黄 | 中香 | 12.11 | 8.89 | 否 |
45 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 软叶金桂 | 金桂 | 5C | 黄 | 中香 | 22.89 | 4.33 | 是 |
46 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 山茶金桂 | 金桂 | 4D | 白 | 中香 | 8.78 | 5.44 | 否 |
47 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 速生金桂 | 金桂 | 3C | 黄 | 浓香 | 36.22 | 7.00 | 否 |
48 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 小花金桂 | 金桂 | 4D | 白 | 浓香 | 22.33 | 4.44 | 否 |
49 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 湘金 | 金桂 | 15B | 黄 | 中香 | 12.33 | 5.00 | 否 |
50 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 小叶金桂 | 金桂 | 5C | 黄 | 中香 | 6.56 | 8.33 | 是 |
51 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 圆瓣金桂 | 金桂 | 10B | 黄 | 中香 | 36.11 | 5.33 | 否 |
52 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 柱冠金桂 | 金桂 | 9A | 黄 | 浓香 | 8.44 | 6.11 | 是 |
53 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 早秋红 | 金桂 | 163C | 黄 | 中香 | 32.11 | 6.90 | 是 |
54 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 橙黄四季桂 | 四季桂 | 13C | 黄 | 浓香 | 19.00 | 8.00 | 否 |
55 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 淡妆 | 四季桂 | 4C | 黄 | 微香 | 22.89 | 5.44 | 是 |
56 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 墨宝香 | 四季桂 | 7C | 黄 | 中香 | 10.78 | 6.78 | 否 |
57 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 日香桂黄 | 四季桂 | 4A | 黄 | 中香 | 22.33 | 6.00 | 否 |
58 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 日香桂 | 四季桂 | 4C | 黄 | 浓香 | 26.89 | 8.00 | 否 |
59 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 四季桂 | 四季桂 | 4A | 黄 | 中香 | 11.11 | 6.00 | 否 |
60 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 天女散花 | 四季桂 | 7B | 黄 | 中香 | 20.11 | 5.67 | 否 |
61 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 天香台阁 | 四季桂 | 11A | 黄 | 中香 | 11.11 | 6.67 | 否 |
62 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 圆叶四季桂 | 四季桂 | 3C | 黄 | 微香 | 9.11 | 5.11 | 否 |
63 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 白洁 | 银桂 | 1D | 白 | 微香 | 8.67 | 5.00 | 是 |
64 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 波叶银桂 | 银桂 | 2D | 黄 | 中香 | 10.11 | 4.89 | 否 |
65 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 柴桂 | 银桂 | 2A | 黄 | 中香 | 10.56 | 4.78 | 否 |
66 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 长叶碧珠 | 银桂 | 5A | 黄 | 中香 | 21.89 | 4.67 | 否 |
67 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 串银球 | 银桂 | 4D | 白 | 浓香 | 22.33 | 8.67 | 否 |
68 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 长叶银桂 | 银桂 | 5D | 黄 | 微香 | 13.11 | 5.33 | 否 |
69 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 大叶银桂 | 银桂 | 5D | 黄 | 中香 | 10.33 | 2.89 | 是 |
70 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 宽叶籽银 | 银桂 | 6D | 黄 | 中香 | 23.00 | 5.33 | 是 |
71 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 绿梗籽银 | 银桂 | 4C | 黄 | 中香 | 33.44 | 6.00 | 是 |
72 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 柳叶桂 | 银桂 | 6C | 黄 | 中香 | 24.11 | 6.56 | 否 |
73 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 密结银桂 | 银桂 | 8B | 黄 | 浓香 | 21.22 | 5.11 | 否 |
74 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 青尖 | 银桂 | 11A | 黄 | 浓香 | 22.78 | 6.67 | 否 |
75 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 速生银桂 | 银桂 | 3C | 黄 | 浓香 | 11.22 | 6.11 | 否 |
76 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 晚银桂 | 银桂 | 8D | 黄 | 中香 | 19.00 | 6.11 | 否 |
77 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 尾叶银桂 | 银桂 | 12B | 黄 | 浓香 | 25.89 | 8.11 | 否 |
78 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 秀丽银桂 | 银桂 | 7B | 黄 | 浓香 | 23.33 | 7.11 | 否 |
79 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 香云 | 银桂 | 4C | 黄 | 微香 | 32.56 | 4.56 | 否 |
80 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 小叶苏桂 | 银桂 | 4B | 黄 | 浓香 | 23.00 | 8.78 | 否 |
81 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 玉帘碧珠 | 银桂 | 1D | 黄 | 中香 | 7.33 | 6.11 | 否 |
82 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 玉玲珑 | 银桂 | 10A | 黄 | 浓香 | 30.22 | 8.78 | 否 |
83 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 玉帘银丝 | 银桂 | 2C | 黄 | 中香 | 9.89 | 6.78 | 否 |
84 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 杨梅叶银桂 | 银桂 | 13B | 黄 | 浓香 | 10.56 | 5.00 | 否 |
85 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 银星 | 银桂 | 9B | 黄 | 中香 | 22.22 | 5.00 | 否 |
86 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 银盏碧珠 | 银桂 | 5B | 黄 | 中香 | 24.33 | 6.56 | 否 |
87 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 玉柱 | 银桂 | 4A | 黄 | 中香 | 19.44 | 6.33 | 否 |
88 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 中华龙桂 | 银桂 | 157C | 白 | 微香 | 10.78 | 7.67 | 否 |
89 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 籽银桂 | 银桂 | 5B | 黄 | 中香 | 27.33 | 8.11 | 是 |
90 | 浙江省杭州市余杭区国家桂花种质资源库 | 早银桂 | 银桂 | 10B | 黄 | 微香 | 25.44 | 8.33 | 否 |
表1
14个核心SNP标记信息"
SNP名称 SNP name | 染色体 chromosome | 物理位置 position | 所在基因 gene | 基因注释 gene annotation | 变异类型 variation type | 次要等位 基因频率 MAF | 多态信息 含量 PIC | He |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
SNP1 | 1 | 2 570 938 | VPS35B | 液泡分选相关蛋白35B vacuolar protein sorting-associated protein 35B | TS | 0.483 | 0.375 | 0.499 |
SNP2 | 2 | 27 947 738 | E5.1.3.15 | 葡萄糖-6-磷酸-1-差向异构酶 glucose-6-phosphate 1-epimerase | TS | 0.343 | 0.349 | 0.451 |
SNP3 | 3 | 24 737 420 | GLU | 谷氨酸合成酶 glutamate synthase | TS | 0.208 | 0.275 | 0.329 |
SNP4 | 6 | 3 953 530 | MAP65-3 | 微管相关蛋白(MAP65/ASE1)家族蛋白 microtubule associated protein (MAP65/ASE1) family protein | TS | 0.348 | 0.351 | 0.454 |
SNP5 | 7 | 4 581 291 | 4CLL7 | 4-香豆酸辅酶A连接酶 4-coumarate CoA ligase | TV | 0.174 | 0.246 | 0.288 |
SNP6 | 9 | 11 920 715 | RECQL5 | ATP依赖的DNA解旋酶 ATP-dependent DNA helicase | TS | 0.360 | 0.354 | 0.461 |
SNP7 | 11 | 7 705 120 | LDL1 | 组蛋白赖氨酸特异性去甲基化酶1 lysine-specific histone demethylase 1 | TS | 0.466 | 0.374 | 0.498 |
SNP8 | 13 | 2 4914 140 | CASBPX2 | 环阿屯醇合成酶 cycloartenol synthase 2 | TV | 0.180 | 0.251 | 0.295 |
SNP9 | 14 | 1 455 309 | CLASP | 微管结合蛋白 CLIP-associated protein | TS | 0.202 | 0.271 | 0.323 |
SNP10 | 15 | 27 882 455 | ABCB19 | ATP结合盒亚家族B19 ATP binding cassette subfamily B19 | TV | 0.489 | 0.375 | 0.500 |
SNP11 | 18 | 26 280 736 | SCPL7 | 丝氨酸羧肽酶7 serine carboxypeptidase-like 7 | TV | 0.427 | 0.370 | 0.489 |
SNP12 | 23 | 10 404 919 | MCM4 | DNA复制许可因子MCM4 DNA replication licensing factor MCM4 | TV | 0.399 | 0.365 | 0.480 |
SNP13 | 23 | 17 820 664 | SPPL4 | 信号肽肽酶4 signal peptide peptidase-like 4 | TS | 0.489 | 0.375 | 0.500 |
SNP14 | 23 | 20 338 374 | At4g22670 | 热休克蛋白70 1 HSP70-interacting protein 1 | TV | 0.365 | 0.356 | 0.464 |
表2
14个核心SNP位点的KASP引物信息"
SNP名称 SNP name | 引物编号 primer No. | 引物序列 primer sequence |
---|---|---|
SEQ ID NO.1 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGATCCCAGCGGAAAGCCATTTC | |
SNP1 | SEQ ID NO.2 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGATCCCAGCGGAAAGCCATTTT |
SEQ ID NO.3 | GATCGCCGGCGTAGCAGAAGAC | |
SEQ ID NO.4 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTTCAACTGCTGCTTTCTGATCCC | |
SNP2 | SEQ ID NO.5 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTCTTCAACTGCTGCTTTCTGATCCT |
SEQ ID NO.6 | CATTCTTGAAATGGATTGTTCCGAGGC | |
SEQ ID NO.7 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGAAAACCTATACGAGTCTAAGCCC | |
SNP3 | SEQ ID NO.8 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGAAAACCTATACGAGTCTAAGCCT |
SEQ ID NO.9 | AATGTTACAGGAAGATGTGGCTTTATTAAAG | |
SEQ ID NO.10 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGGTTTTTGGGGTTCTGCTTTCG | |
SNP4 | SEQ ID NO.11 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTCATGGTTTTTGGGGTTCTGCTTTCA |
SEQ ID NO.12 | GGCAAGTCCAATGAAGAATGTTTCCAG | |
SEQ ID NO.13 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGATGAACAAGGTTGGGTACATACC | |
SNP5 | SEQ ID NO.14 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGATGAACAAGGTTGGGTACATACG |
SEQ ID NO.15 | CCCTCGTCATCAAAATAGCCAAGATC | |
SEQ ID NO.16 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTAGCAAGTCCATGCAGTATCCTC | |
SNP6 | SEQ ID NO.17 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTCTAGCAAGTCCATGCAGTATCCTT |
SEQ ID NO.18 | CTTCAGAGTAATTCACAAGCAAAATTTACCC | |
SEQ ID NO.19 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTCCACATTCGCCTCGATCTCC | |
SNP7 | SEQ ID NO.20 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTTACCACATTCGCCTCGATCTCT |
SEQ ID NO.21 | GATTTCCCGTGGACTCCCTTACTG | |
SEQ ID NO.22 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTAGCAGATACCTTATTTACAGGTCCA | |
SNP8 | SEQ ID NO.23 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGCAGATACCTTATTTACAGGTCCC |
SEQ ID NO.24 | TACATTATGAGGATAAAAACACTCATTATGTATG | |
SEQ ID NO.25 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGCACCAACTTCTGGAAGCTTAC | |
SNP9 | SEQ ID NO.26 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTCTGCACCAACTTCTGGAAGCTTAT |
SEQ ID NO.27 | CGTCACCTCAGATGACGTCAAACTC | |
SEQ ID NO.28 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGTCTCCGGCATTGTTTTTCCTTCA | |
SNP10 | SEQ ID NO.29 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGTCTCCGGCATTGTTTTTCCTTCT |
SEQ ID NO.30 | TTCAGAGCTATCTGATAAAATGGCTGAG | |
SEQ ID NO.31 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTCAAAATGTGAACTTTGTTTACATGACG | |
SNP11 | SEQ ID NO.32 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTATACAAAATGTGAACTTTGTTTACATGACT |
SEQ ID NO.33 | GTTCCATTGTATCATCGAATATTGCAGTG | |
SEQ ID NO.34 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGCAACATAATTATGGAGAAGATGCAAA | |
SNP12 | SEQ ID NO.35 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGCAACATAATTATGGAGAAGATGCAAC |
SEQ ID NO.36 | CTCCAACATGCGAGTCGAGGGC | |
SEQ ID NO.37 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTTGGTGAAGAAGTAATGGAGTTTGTC | |
SNP13 | SEQ ID NO.38 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTAATGGTGAAGAAGTAATGGAGTTTGTT |
SEQ ID NO.39 | AAGGTGGGACCAAACCGAGCAC | |
SEQ ID NO.40 | GAAGGTGACCAAGTTCATGCTCCAATATACAGGACGCTGAATTGAT | |
SNP14 | SEQ ID NO.41 | GAAGGTCGGAGTCAACGGATTCCAATATACAGGACGCTGAATTGAG |
SEQ ID NO.42 | GCACCAATCACTTCTGGATCATTGAATG |
表3
90份桂花品种的种质资源信息编码与指纹码转换"
编号 code | 品种 cultivar | 品种群编码 cultivar group code | 品种特征编码 information code | 指纹码 fingerprint code |
---|---|---|---|---|
1 | ‘橙香丹桂’‘Chengxiang Dangui’ | 3 | 321120 | 2233211133214413334124133442 |
2 | ‘潢川金桂’‘Huangchuan Jingui’ | 1 | 112231 | 1133211133223411344144133442 |
3 | ‘鄂橙’‘Echeng’ | 3 | 322210 | 2133211133224411344144133322 |
4 | ‘娇容’‘Jiaorong’ | 3 | 322110 | 2134211133213411334124134422 |
5 | ‘象山丹桂’‘Xiangshan Dangui’ | 3 | 323221 | 1133221132223411444144133322 |
6 | ‘金狮桂’‘Jinshigui’ | 1 | 112220 | 2144211133113311334444333422 |
7 | ‘齿丹桂’‘Chidangui’ | 3 | 321110 | 2134211132214413341124133322 |
8 | ‘橙红丹桂’‘Chenghong Dangui’ | 3 | 322121 | 1133222122113311331122333442 |
9 | ‘红桂’‘Honggui’ | 3 | 322221 | 2133211133214413334124133442 |
10 | ‘火炼金丹’‘Huolian Jindan’ | 3 | 321120 | 2134212133213411344424113422 |
11 | ‘莲籽丹桂’‘Lianzi Dangui’ | 3 | 321220 | 1134211133213411334424333442 |
12 | ‘满条红’‘Mantiaohong’ | 3 | 322120 | 2133211133214413334422133342 |
13 | ‘平脉丹桂’‘Pingmai Dangui’ | 3 | 322120 | 2134222132223311341144333342 |
14 | ‘软叶丹桂’‘Ruanye Dangui’ | 3 | 322110 | 2133211133224411344124113322 |
15 | ‘上海丹桂’‘Shanghai Dangui’ | 3 | 322210 | 2134222233114413344122134442 |
16 | ‘桃叶丹桂’‘Taoye Dangui’ | 3 | 322130 | 2234211133214413341122133322 |
17 | ‘晚霞’‘Wanxia’ | 3 | 322120 | 2134212133213411334124113422 |
18 | ‘武夷丹桂’‘Wuyi Dangui’ | 3 | 321220 | 2134211133213411334124134442 |
19 | ‘雄黄桂’‘Xionghuanggui’ | 3 | 321120 | 1133221132213411331124333442 |
20 | ‘小叶丹桂’‘Xiaoye Dangui’ | 3 | 322230 | 1133221132223411444444333322 |
21 | ‘堰虹桂’‘Yanhonggui’ | 3 | 322120 | 1133222133113311331122333442 |
22 | ‘硬叶丹桂’‘Yingye Dangui’ | 3 | 322210 | 2234222132223411334124133442 |
23 | ‘醉肌红’‘Zuijihong’ | 3 | 322210 | 2133211133224411344122133322 |
24 | ‘朱砂丹桂’‘Zhusha Dangui’ | 3 | 321310 | 2134211133223411331144333422 |
25 | ‘状元红’‘Zhuangyuanhong’ | 3 | 322110 | 2134211133223411334144333422 |
26 | ‘编金桂’‘Bianjingui’ | 1 | 113120 | 2234222133213411334424333442 |
27 | ‘长瓣金桂’‘Changban Jingui’ | 1 | 112120 | 2144221132223413331144333344 |
28 | ‘长柄金桂’‘Changbing Jingui’ | 1 | 102220 | 2233222133213411331124333444 |
29 | ‘丛中笑’‘Congzhongxiao’ | 1 | 112221 | 2133222132223411341144333342 |
30 | ‘大花金桂’‘Dahua Jingui’ | 1 | 113210 | 2234211133223411334124134442 |
31 | ‘大叶黄’‘Dayehuang’ | 1 | 113120 | 2233222133223411331124333444 |
32 | ‘大叶金桂’‘Daye Jingui’ | 1 | 113231 | 2133222233213413334122113342 |
33 | ‘芙蓉桂’‘Furonggui’ | 1 | 112320 | 2133222133223313334124134442 |
34 | ‘杭州黄’‘Hangzhouhuang’ | 1 | 112110 | 1144212133224413341124133422 |
35 | ‘黑珍珠’‘Heizhenzhu’ | 1 | 111220 | 2233222133213413334144133442 |
36 | ‘金桂河边’‘Jingui Hebian’ | 1 | 112210 | 1133212133113311344422134442 |
37 | ‘金球桂’‘Jinqiugui’ | 1 | 112320 | 2134212233213411344124113422 |
38 | ‘金秋早’‘Jinqiuzao’ | 1 | 102320 | 1133222133113313334124334422 |
39 | ‘镰叶金桂’‘Lianye Jingui’ | 1 | 111320 | 2133221133223411334144114442 |
40 | ‘柳叶黄’‘Liuyehuang’ | 1 | 112120 | 2233221133213333334424113444 |
41 | ‘柳叶金桂’‘Liuye Jingui’ | 1 | 112210 | 2233221133223411334144113442 |
42 | ‘柳叶苏桂’‘Liuye Sugui’ | 1 | 113330 | 2233221133214411334124334422 |
43 | ‘漓锗金桂’‘Lizhe Jingui’ | 1 | 112130 | 1133222133113311344424134442 |
44 | ‘球桂’‘Qiugui’ | 1 | 112130 | 1134222132223411344144134422 |
45 | ‘软叶金桂’‘Ruanye Jingui’ | 1 | 112211 | 2233221132213313331144133444 |
46 | ‘山茶金桂’‘Shancha Jingui’ | 1 | 102110 | 2133222133214411334422334422 |
47 | ‘速生金桂’‘Susheng Jingui’ | 1 | 113320 | 1133112133113311344424134442 |
48 | ‘小花金桂’‘Xiaohua Jingui’ | 1 | 103210 | 1134212132213411444124333422 |
49 | ‘湘金’‘Xiangjin’ | 1 | 112120 | 2134212133213411344124113422 |
50 | ‘小叶金桂’‘Xiaoye Jingui’ | 1 | 112131 | 2133222233213411334444334422 |
51 | ‘圆瓣金桂’‘Yuanban Jingui’ | 1 | 112310 | 2133222133214411334424334422 |
52 | ‘柱冠金桂’‘Zhuguan Jingui’ | 1 | 113121 | 1144212232223411331124334422 |
53 | ‘早秋红’‘Zaoqiuhong’ | 1 | 112321 | 2234221132113413334124134442 |
54 | ‘橙黄四季桂’‘Chenghuang Sijigui’ | 4 | 413120 | 2133221132213411334124333322 |
55 | ‘淡妆’‘Danzhuang’ | 4 | 411211 | 1144221133213433331144333342 |
56 | ‘墨宝香’‘Mobaoxiang’ | 4 | 412120 | 1134222132223411334144333442 |
57 | ‘日香桂黄’‘Rixiang Guihuang’ | 4 | 412220 | 1134222222223311331144134444 |
58 | ‘日香桂’‘Rixianggui’ | 4 | 413220 | 2133222233213311334422113342 |
59 | ‘四季桂’‘Sijigui’ | 4 | 412120 | 2133211132214413344124134442 |
60 | ‘天女散花’‘Tiannv Sanhua’ | 4 | 412210 | 2134212133223413344444333422 |
61 | ‘天香台阁’‘Tianxiang Taige’ | 4 | 412120 | 2133222132223411334124333422 |
62 | ‘圆叶四季桂’‘Yuanye Sijigui’ | 4 | 411110 | 2234211132223413344144134442 |
63 | ‘白洁’‘Baijie’ | 2 | 201121 | 2244212133114413344424333444 |
64 | ‘波叶银桂’‘Boye Yingui’ | 2 | 212110 | 2134222233213411334122113342 |
65 | ‘柴桂’‘Chaigui’ | 2 | 212110 | 2234222132213313341144334444 |
66 | ‘长叶碧珠’‘Changye Bizhu’ | 2 | 212210 | 2144222133224411334444333444 |
67 | ‘串银球’‘Chuanyinqiu’ | 2 | 203230 | 2134222232213311331124333442 |
68 | ‘长叶银桂’‘Changye Yingui’ | 2 | 211110 | 2233222132223411334124133442 |
69 | ‘大叶银桂’‘Daye Yingui’ | 2 | 212111 | 2134221133214413334124133422 |
70 | ‘宽叶籽银’‘Kuanye Ziyin’ | 2 | 212211 | 2144221133213411334144333344 |
71 | ‘绿梗籽银’‘Lvgeng Ziyin’ | 2 | 212321 | 1134221133224413334124133322 |
72 | ‘柳叶桂’‘Liuyegui’ | 2 | 212220 | 1144221133214411441124333422 |
73 | ‘密结银桂’‘Mijie Yingui’ | 2 | 213210 | 1134222122223313334122133442 |
74 | ‘青尖’‘Qingjian’ | 2 | 213220 | 2134221132214411344144134422 |
75 | ‘速生银桂’‘Susheng Yingui’ | 2 | 213120 | 2134212133213411344124113442 |
76 | ‘晚银桂’‘Wanyingui’ | 2 | 212120 | 2234222133214413334124133342 |
77 | ‘尾叶银桂’‘Weiye Yinggui’ | 2 | 213230 | 2234112133213411344124113422 |
78 | ‘秀丽银桂’‘Xiuli Yingui’ | 2 | 213220 | 1144212133223311331124334422 |
79 | ‘香云’‘Xiangyun’ | 2 | 211310 | 1144222133224411334444333444 |
80 | ‘小叶苏桂’‘Xiaoye Sugui’ | 2 | 213230 | 1133211133224411344444113422 |
81 | ‘玉帘碧珠’‘Yulian Bizhu’ | 2 | 212120 | 1134222132213333334424133342 |
82 | ‘玉玲珑’‘Yulinglong’ | 2 | 213330 | 1134211133224411344444113422 |
83 | ‘玉帘银丝’‘Yulian Yinsi’ | 2 | 212120 | 2133222233213411334422113342 |
84 | ‘杨梅叶银桂’‘Yangmeiye Yingui’ | 2 | 213120 | 2133221133223411334144113442 |
85 | ‘银星’‘Yinxing’ | 2 | 212220 | 2134222233113413334122113342 |
86 | ‘银盏碧珠’‘Yinzhan Bizhu’ | 2 | 212220 | 2233221133213411334122133422 |
87 | ‘玉柱’‘Yuzhu’ | 2 | 212120 | 2233222132213413334124133444 |
88 | ‘中华龙桂’‘Zhonghua Longgui’ | 2 | 201120 | 1134222132223313334444333442 |
89 | ‘籽银桂’‘Ziyingui’ | 2 | 212231 | 2234221133224411441124133422 |
90 | ‘早银桂’‘Zaoyingui’ | 2 | 211230 | 2234112233223411334122334444 |
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