毛竹PeSCL6基因的克隆及其表达分析

doi:10.3969/j.issn.1000-2006.2014.02.009

国家林草科技领军期刊
中国精品科技期刊
中国高校百佳科技期刊
江苏省新闻出版政府奖期刊奖
RCCSE林学权威期刊（A+）
CSCD核心期刊
Scopus数据库收录期刊
中文核心期刊
SCD核心期刊

作者加群：102861116

微信公众号：南京林业大学学报

高级检索

南京林业大学学报（自然科学版） ›› 2014, Vol. 38 ›› Issue (02): 43-46.doi: 10.3969/j.issn.1000-2006.2014.02.009

毛竹PeSCL6基因的克隆及其表达分析

陈东亮^1,2, 彭镇华^1,3, 高志民^1*

1.国际竹藤中心,国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室,北京 100102;
2.北京市农林科学院, 北京农业生物技术研究中心,北京 100097;
3. 中国林业科学研究院林业研究所,北京 100091

出版日期:2014-03-10 发布日期:2014-03-10
基金资助:
收稿日期:2013-03-29 修回日期:2013-11-18
基金项目:国家林业局“948”项目(2011-4-55); 国家林业公益性行业科研专项项目(200704001)
第一作者:陈东亮,助理研究员,博士。*通信作者:高志民,研究员。E-mail: gaozhimin@icbr.ac.cn。
引文格式:陈东亮,彭镇华,高志民. 毛竹PeSCL6基因的克隆及其表达分析[J]. 南京林业大学学报:自然科学版,2014,38(2):43-46.

Cloning and expression analysis of PeSCL6 gene in Phyllostachys edulis Carr.

CHEN Dongliang^1,2, PENG Zhenhua^1,3, GAO Zhimin^1*

1. International Center for Bamboo and Rattan, Key Laboratory on the Science and Technology of Bamboo and Rattan, SFA, Beijing 100102, China;
2. Beijing Agro-Biotechnology Research Center, Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Beijin

Online:2014-03-10 Published:2014-03-10

摘要/Abstract

摘要： SCL6基因是植物保持茎端分生组织未分生状态所必需的关键基因之一。采用RT-PCR和RACE方法从毛竹(Phyllostachys edulis Carr.)中获得一个SCL6同源基因,命名为PeSCL6。该基因全长1 894 bp,其中5'端非编码区60 bp,3'端非编码区211 bp,编码区1 623 bp,共编码540个氨基酸。序列分析表明:PeSCL6基因编码的蛋白含有LHRI、VHIID、LHRII、PFYRE和SAW 5个保守区,属于GRAS家族蛋白; 该蛋白与水稻、玉米、高粱等单子叶植物的SCL6有较高的一致性(70%以上)。实时定量PCR结果表明:PeSCL6基因为组成型表达,且在叶片中的表达丰度最高; 而在即将开花之前和处于盛花期的竹株叶片中PeSCL6表达丰度明显降低,分别为幼龄竹株叶片的1%和14%。PeSCL6基因表达的变化,意味着它可能参与毛竹由营养生长向生殖生长的转换调控。

Abstract: SCL6 is one of the key genes for plant to maintain the shoot apical meristem tissue in indeterminate state. A homologue gene of SCL6 was cloned from moso bamboo(Phyllostachys edulis Carr.)using RT-PCR and RACE methods, and named as PeSCL6. The full length of PeSCL6 was 1 894 bp including 60 bp 5' untranslated region(UTR), 211 bp 3' UTR and an open reading frame of 1 623 bp, which encoded 489 amino acids. Blastp analysis indicated that PeSCL6 had high identities with SCL6 from monocotyledon plants(all up to more than 70%)such as Zea mays, Oryza sativa and Sorghum bicolor. Real time PCR analysis showed that PeSCL6 expressed constitutively with the highest level in leaves of young seedlings. However, the PeSCL6 expressed much lower in the leaves at adult bamboo at just before and full blooming stages, which were only 1% and 14% of that in young seedling leaves, respectively. The changes of expression level in leaves indicated that PeSCL6 gene might be involved in the switch regulation of moso bamboo from vegetative to reproductive growth.

中图分类号:

Q78
S795

陈东亮,彭镇华,高志民. 毛竹PeSCL6基因的克隆及其表达分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2014, 38(02): 43-46.

CHEN Dongliang, PENG Zhenhua, GAO Zhimin. Cloning and expression analysis of PeSCL6 gene in Phyllostachys edulis Carr.[J].Journal of Nanjing Forestry University (Natural Science Edition), 2014, 38(02): 43-46.DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.2014.02.009.

参考文献

[1] Lee M H, Kim B, Song S K, et al. Large-scale analysis of the GRAS gene family in Arabidopsis thaliana[J]. Plant Molecular Biology, 2008, 67(6): 659-670.
[2] Engstrom E M, Andersen C M, Gumulak-Smith J, et al. Arabidopsis homologs of the petunia hairy meristem gene are required for maintenance of shoot and root indeterminacy[J]. Plant Physiology, 2011, 155(2): 735-750.
[3] Stuurman J, Jäggi F, Kuhlemeier C. Shoot meristemmaintenance is controlled by a GRAS-gene mediated signal from differentiating cells[J]. Genes Development, 2002, 16(17): 2213-2218.
[4] Schulze S, Schäfer B N, Parizotto E A, et al. LOST MERISTEMS genes regulate cell differentiation of central zone descendants in Arabidopsis shoot meristems[J]. Plant Journal, 2010, 64(4): 668-678.
[5] Wang L, Mai Y X, Zhang Y C, et al. MicroRNA171c-targeted SCL6-Ⅱ, SCL6-Ⅲ, and SCL6-IV genes regulate shoot branching in Arabidopsis[J]. Molecular Plant, 2010, 3(5): 794-806.
[6] 熊文愈,丁祖福,李又芬.竹类植物的居间分生组织与节间生长Ⅰ秆茎的居间分生组织与节间生长[J]. 林业科学,1980,16(2):81-89. Xiong W Y, Ding Z F, Li Y F. Intercalary meristem and internodal elongation of bamboo plants[J].Scientia Silvae Sinicae, 1980, 16(2): 81-89.
[7] 吴晓宇,胡尚连,曹颖,等. 慈竹CCoAOMT基因的克隆及生物信息学分析[J]. 南京林业大学学报:自然科学版, 2012, 36(3):17-22. Wu X Y, Hu S L, Cao Y, et al. Cloning of CCoAOMT gene in Neosinocalamus affinis and its bioinformatics analysis[J]. Journal of Nanjing Forestry University:Natural Sciences Edition, 2012, 36(3):17-22.
[8] Gao Z M, Li X P, Li L L, et al. An effective method for total RNA isolation from bamboo[J]. Chinese Forestry Science and Technology, 2006, 5(3): 52-54.
[9] 高志民,彭镇华,李雪平,等.毛竹苯丙氨酸解氨酶基因的克隆及组织特异性表达分析[J]. 林业科学研究,2009,22(3):449-453. Gao Z M, Peng Z H, Li X P, et al. Isolation and tissue specific expression analysis of phenylanlanine ammonialyase gene from Phyllostachys edulis[J]. Forest Research, 2009, 22(3): 449-453.
[10] Livak K J, Schmittgen D T. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2^-ΔΔCt method[J]. Methods, 2001, 25(4): 402-408.
[11] Pysh D L, Wysocka-Diller J W,Camilleri C, et al. The GRAS gene family in Arabidopsis: sequence characterization and basic expression analysis of the SCARECROW-LIKE genes[J].The Plant Journal, 1999, 18(1): 111-119.
[12] Bolle C, Koncz C, Chua N H. PAT1, a new member of the GRAS family, is involved in phytochrome A signal transduction[J]. Genes Development, 2000, 14(10): 1269-1278.
[13] Brand U, Fletcher J C, Hobe M, et al. Dependence of stem cell fate in Arabidopsis on a feedback loop regulated by CLV3 activity[J]. Science, 2000, 289: 617-619.
[14] Schoof H, Lenhard M, Haecker A, et al. The stem cell population of Arabidopsis shoot meristems is maintained by a regulatory loop between the CLAVATA and WUSCHEL genes[J]. Cell, 2000, 100(6): 635-644.
[15] Long J A, Moan E I, Medford J I, et al. A member of the KNOTTED class of homeodomain proteins encoded by the STM gene of Arabidopsis[J]. Nature, 1996, 379: 66-69.
[16] Eric M E. HAM proteins promote organ indeterminacy: but how?[J]. Plant Signaling and Behavior, 2012, 7(2): 227-234.
[17] Mi-Hyun L, Bohye K, Sang-Kee S, et al. Large-scale analysis of the GRAS gene family in Arabidopsis thaliana[J]. Plant Molecular Biology, 2008, 67(6): 659-670.

相关文章 15

[1]	杨蕴力, 曹俐, 王阳, 顾宸瑞, 陈坤, 刘桂丰. BpGLK1基因干扰表达对裂叶桦叶色及生长的影响[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(1): 18-28.
[2]	王伟, 邱志楠, 李爽, 白向东, 刘桂丰, 姜静. CRISPR/Cas9核糖核蛋白介导的无T-DNA插入的白桦BpGLK1精准突变[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(1): 11-17.
[3]	王质璞, 李卓蓉, 罗志斌, 邓澍荣. PagAPY1基因调控银腺杨耐旱性的作用机制研究[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(6): 105-112.
[4]	却枫, 刘庆楠, 查若飞, 魏强. 孝顺竹中笋箨衰老相关WRKY转录因子的鉴定与分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(6): 113-123.
[5]	刘亚梅, 刘盛全, 周亮, 胡建军, 赵自成, 郑向丽. 8个杨树无性系/品种木材解剖特征及其径向变异模式[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(1): 234-240.
[6]	却枫, 查若飞, 魏强. 植物纤维素合成酶研究进展[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2022, 46(6): 207-214.
[7]	龚珏, 毕浩, 杨雯露, 王东明, 王乐辉, 姜渊忠, 马涛. 山桐子IpSAD基因家族分析及功能鉴定[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2022, 46(6): 261-270.
[8]	何青青, 刘传强, 李建建, 王晶晶, 姚祥, 周圣浩, 陈英, 王浩然. 假俭草EoNLA基因克隆与其转基因拟南芥在不同磷水平下的表型鉴定[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2022, 46(3): 134-142.
[9]	王占军, 吴子琦, 王朝霞, 欧祖兰, 李杰, 蔡倩文, 徐忠东, 张照亮. 3个茶树品种WOX基因家族的进化及密码子偏好性比较[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2022, 46(2): 71-80.
[10]	何旭东, 郑纪伟, 教忠意, 窦全琴, 黄利斌. 基于SLAF-seq技术的舒玛栎群体遗传多样性与遗传结构分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2022, 46(2): 81-87.
[11]	严志祥, 杨海燕, 樊苏帆, 吴文龙, 闾连飞, 李维林. 黑莓果实发育过程中蔗糖磷酸合成酶基因的表达分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2022, 46(1): 179-186.
[12]	张群, 及晓宇, 贺子航, 王智博, 田增智, 王超. 白桦BpGRAS1基因的克隆及耐盐功能分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2021, 45(5): 38-46.
[13]	周芳伟, 吴怀通, 尹佟明. MIXTA/MIXTA-like基因特征及其对植物表皮细胞分化的调控[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2021, 45(4): 229-237.
[14]	鞠烨, 江建平, 尹增芳, 魏强. 孝顺竹笋箨全长转录组测序分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2020, 44(6): 175-183.
[15]	陈文文, 吴怀通, 陈赢男. SPL家族基因复制及功能分化分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2020, 44(5): 55-66.

毛竹PeSCL6基因的克隆及其表达分析

Cloning and expression analysis of PeSCL6 gene in Phyllostachys edulis Carr.

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

作者

读者

审稿