美国山核桃种质资源遗传多样性ISSR分析

doi:10.3969/j.issn.1000-2006.2015.04.002

国家林草科技领军期刊
中国精品科技期刊
中国高校百佳科技期刊
江苏省新闻出版政府奖期刊奖
RCCSE林学权威期刊（A+）
CSCD核心期刊
Scopus数据库收录期刊
中文核心期刊
SCD核心期刊

作者加群：102861116

微信公众号：南京林业大学学报

高级检索

南京林业大学学报（自然科学版） ›› 2015, Vol. 58 ›› Issue (04): 7-12.doi: 10.3969/j.issn.1000-2006.2015.04.002

美国山核桃种质资源遗传多样性ISSR分析

李晖¹,张瑞¹,彭方仁^1*,李永荣²,翟敏²

1. 南京林业大学林学院,江苏南京 210037;
2. 南京绿宙薄壳山核桃科技有限公司,江苏南京 210014

出版日期:2015-07-31 发布日期:2015-07-31
基金资助:
收稿日期:2014-04-21 修回日期:2015-02-21基金项目:国家林业公益性行业科研专项项目( 201304711); 江苏高校优势学科建设工程资助项目( PAPD) 第一作者:李晖,硕士。*通信作者:彭方仁,教授。E-mail:frpeng@njfu.edu.cn。引文格式:李晖,张瑞,彭方仁,等. 美国山核桃种质资源遗传多样性ISSR分析[J]. 南京林业大学学报:自然科学版,2015,39(4):7-12.

Genetic diversity and identification of pecan by ISSR markers

LI Hui¹, ZHANG Rui¹, PENG Fangren^1*, LI Yongrong², ZHAI Min²

1.College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China;
2. Nanjing Green Universe Pecan Science &
Technology Co., Ltd., Nanjing 210014, China

Online:2015-07-31 Published:2015-07-31

摘要/Abstract

摘要： 以161个美国山核桃品种及株系、1个核桃品种和1个山核桃品种为试材,利用ISSR分子标记技术对其进行遗传多样性分析。结果表明:14条ISSR引物在供试品种中共扩增出56条谱带,其中55条为多态性条带,多态性指数达98%; 供试品种的基因多样性指数为0.366 8,Shannon多态性信息指数为0.542 8; 品种间相似系数范围为0.29～0.94,平均为0.649 6,表明这些美国山核桃种质资源间的亲缘关系较近。供试品种(单株)的遗传背景比较复杂,根据聚类分析可将这些品种(株系)划分为9个类群。

Abstract: In this study, ISSR markers were used to evaluate the genetic diversity of 161 pecan cultivars and individuals, one walnut cultivar and one Carya cathayensis cultivars. A total of 56 bands were yielded by 14 ISSR premiers, and 55 were amplified bands(98% polymorphic). Nei’s gene diversity He and Shannon’s information index I were 0.366 8 and 0.542 8, respectively. The Nei’s genetic similarity coefficients ranged from 0.29 to 0.94, and the average was 0.649 6, which showed close genetic relationships. According to the results of cluster analysis, the 163 accessions could be divided into 9 groups, which showed that the genetic background was very complex.

中图分类号:

S722

李晖,张瑞,彭方仁,等. 美国山核桃种质资源遗传多样性ISSR分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2015, 58(04): 7-12.

LI Hui, ZHANG Rui, PENG Fangren, LI Yongrong, ZHAI Min. Genetic diversity and identification of pecan by ISSR markers[J].Journal of Nanjing Forestry University (Natural Science Edition), 2015, 58(04): 7-12.DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.2015.04.002.

参考文献

[1] 彭方仁, 李永荣, 梁有旺, 等. 我国薄壳山核桃生产现状与产业化发展策略[J]. 林业科技开发, 2012, 4(1):1-4.Peng F R, Li Y R, Liang Y W, et al. Production status and industrialization development strategy of Carya illinoensis in China[J]. China Forestry Science and Technology, 2012, 4(1):1-4.
[2] 董凤祥, 王贵禧. 美国薄壳山核桃引种及栽培技术[M]. 北京: 金盾出版社, 2003.Dong F X, Wang G X. Pecan introduction and cultivation techniques[M]. Bejing: Jindun Publishing House, 2003.
[3] 吴国良, 张凌云, 潘秋红, 等. 美国山核桃及其品种研究性状[J]. 果树学报, 2003, 20(5): 404-409.Wu G L, Zhang L Y, Pan Q H, et al. Advances in study of pecan and its cultivar’s characteristics[J]. Journal of Fruit Science, 2003, 20(5): 404-409.
[4] 张日清, 李江, 吕芳德, 等. 我国引种美国山核桃历程及资源现状研究[J]. 经济林研究, 2003, 21(4): 107-109.Zhang R Q, Li J, Lv F D, et al. Historical survey of the introduced pecan tree in China: Distribution and resource estimate[J]. Economic Forest Researches, 2003, 21(4): 107-109.
[5] Conner P J, Wood B W. Identification of pecan cultivars and their genetic relatedness as determined by randomly amplied polymorphic DNA analysis[J]. J Amer Soc Hort Sci, 2001, 126: 474-480.
[6] 张日清, 何方, 吕芳德, 等. 美国山核桃群体遗传多样性的RAPD 分析[J]. 经济林研究, 2001, 19(2): 1-6. Zhang R Q, He F, Lv F D, et al. Population genetic analysis by randomly amplified polymorphic DNA markers in pecan [J]. Economic Forest Researches, 2001, 19(2): 1-6.
[7] 张日清, 吕德芳, 谭晓风, 等. 美国山核桃主要栽培样品的RAPD 鉴定[J]. 经济林研究, 2004, 22(4): 1-5.Zhang R Q, Lv F D, Tan X F, et al. Identification of main varieties of American hickory by RAPD [J]. Economic Forest Researches, 2004, 22(4): 1-5.
[8] Grauke L J, Iqbal M J, Reddy A S, et al. Developing mi-crosatellite DNA markers in pecan[J]. J Amer Soc Hort Sci, 2003, 128(3): 374-380.
[9] 佟兆国, 王富荣, 章镇, 等. 一种从果树成熟叶片提取DNA的方法[J]. 果树学报, 2008, 25(1): 122-125.Tong Z G, Wang F R, Zhang Z, et al. A method for DNA extraction from mature leaves of fruit tress[J]. Journal of Fruit Science, 2008, 25(1): 122-125.
[10] 于小玉, 喻方圆, 刘建兵, 等. ISSR在油茶品种鉴别和遗传多样性分析中的应用[J]. 南京林业大学学报:自然科学版, 2013, 37(1): 61-66.Yu X Y, Yu F Y, Liu J B,et al. Identification and genetic diversity analysis of Camellia oleifera varieties using ISSR marker[J]. Journal of Nanjing Forestry University:Natural Sciences Edition, 2013, 37(1): 61-66.
[11] 彭方仁, 吴莺莺, 郝明灼, 等. 利用ISSR和SRAP标记分析油茶遗传多样性[J]. 南京林业大学学报: 自然科学版, 2012, 36(5): 19-25.Peng F R, Wu Y Y, Hao M Z,et al. Genetic diversity of Camellia oleifera using ISSR and SRAP markers[J]. Journal of Nanjing Forestry University:Natural Sciences Edition, 2012, 36(5):19-25.
[12] 马红勃, 祁建民, 李延坤, 等. 烟草SRAP和ISSR分子遗传连锁图谱构建[J]. 作物学报, 2008, 34(11): 1958-1963.Ma H B, Qi J M, Li Y K, et al. Construction of a molecular genetic linkage map of tobacco based on SRAP and ISSR markers[J]. Acta Agronomica Sinica, 2008, 34(11): 1958-1963.
[13] 张晨东, 杨志新, 张聪, 等. 44份香料烟品种ISSR遗传多样性分析[J]. 热带作物学报, 2012, 33(12): 2144-2149.Zhang C D, Yang Z X, Zhang C, et al. ISSR analysis of genetic diversity for 44 oriental tobacco cultivars[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2012, 33(12): 2144-2149.
[14] 施娟娟, 叶生月, 俞世群, 等. 37个新引进的薄壳山核桃品种遗传多样性SSR分析[J]. 安徽农业大学学报, 2013, 40(1):42-46.Shi J J, Ye S Y, Yu S Q,et al. SSR analysis of genetic diversity of the 37 new pecan cultivars[J]. Journal of Anhui Agricultural University, 2013, 40(1):42-46.
[15] 刘广勤, 王鹏良, 周蓓蓓, 等. 薄壳山核桃SRAP标记体系的优化和遗传多样性分析[J]. 江苏农业学报, 2010, 26(5): 1037-1042.Liu G Q, Wang P L, Zhou B B, et al. Optimization of SRAP marker reaction system and genetic diversity for Carya illinoensis Koch[J]. Jiangsu Journal of Agricultural Sciences, 2010, 26(5): 1037-1042.
[16] Jia X D, Wang T, Zhai M,et al.Genetic diversity and identification of Chinese-Grown pecan using ISSR and SSR markers [J].Molecules, 2011, 16(12): 10078-10092.
[17] 刘晓丽, 陈学森, 张美勇, 等. 普通核桃(Juglansregia)3个群体遗传结构的SSR分析[J]. 果树学报, 2008, 25(4):526-530.Liu X L, Chen X S, Zhang M Y,et al. Population genetic structure analysis of Juglans regia using SSR makers[J]. Journal of Fruit Science, 2008, 25(4): 526-530.
[18] 肖志娟, 翟梅枝, 许静, 等. 不同核桃品种的ISSR标记分析[J]. 北方园艺, 2013(4): 103-107.Xiao Z J, Zhai M Z, Xu J, et al. Analysis of different Walnut Varieties by ISSR Marker[J]. Northern Horticulture, 2013(4): 103-107.

相关文章 15

[1]	王改萍, 章雷, 曹福亮, 丁延朋, 赵群, 赵慧琴, 王峥. 红蓝光质对银杏苗木生长生理特性及黄酮积累的影响[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(2): 105-112.
[2]	宋子琪, 卞国良, 林峰, 胡凤荣, 尚旭岚. 流式细胞仪鉴定青钱柳倍性方法的建立及其应用[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(2): 61-68.
[3]	孙旭高, 陶家璐, 谢微, 石洁, 张宝津, 邓小梅. 米老排优树组培技术体系优化研究[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(2): 69-78.
[4]	顾宸瑞, 袁启航, 姜静, 穆怀志, 刘桂丰. 基于转录组测序的关联分析定位裂叶桦叶形调控基因[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(1): 39-46.
[5]	杨蕴力, 曹俐, 王阳, 顾宸瑞, 陈坤, 刘桂丰. BpGLK1基因干扰表达对裂叶桦叶色及生长的影响[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(1): 18-28.
[6]	王伟, 邱志楠, 李爽, 白向东, 刘桂丰, 姜静. CRISPR/Cas9核糖核蛋白介导的无T-DNA插入的白桦BpGLK1精准突变[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(1): 11-17.
[7]	国颖, 杨港归, 吴雨涵, 何杰, 何玉洁, 廖浩然, 薛良交. DNA甲基化调控植物组织培养过程的分子机制研究进展[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(6): 1-8.
[8]	陈俊娜, 王晓宇, 陈晨, 彭辉武, 陈娟, 黄卫和, 喻方圆. BR对东京野茉莉种子中脂肪酸合成相关酶活性及油脂积累的影响[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(6): 35-41.
[9]	宫楠, 祖鑫, 解志军, 朱长红, 李淑娴. 紫荆种子吸胀和层积过程中不同相态水分变化的核磁共振检测[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(6): 42-50.
[10]	王章荣, 季孔庶, 徐立安, 邹秉章, 林能庆, 林景泉. 马尾松实生种子园营建技术、现实增益及多世代低成本经营新模式探讨[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(6): 9-16.
[11]	欧阳, 欧阳芳群, 孙猛, 王超, 王军辉, 安三平, 王丽芳, 许娜, 王猛. 欧洲云杉无性系幼龄生长节律、年度和密度互作效应及选择策略[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(6): 95-104.
[12]	罗芊芊, 李峰卿, 肖德卿, 邓章文, 王建华, 周志春. 两个南方红豆杉天然居群的交配系统分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(5): 80-86.
[13]	郭伟, 韩秀, 张利, 王迎, 杜辉, 燕语, 孙忠奎, 张林, 李国华, 罗磊. 青檀扦插苗对不同氮素水平的形态、光合生理响应和转录组分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(5): 87-96.
[14]	刘蓉, 吴德军, 王因花, 任飞, 李丽, 燕丽萍, 周晓锋. 白蜡花粉最佳离体萌发培养基筛选[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(3): 70-76.
[15]	张港隆, 朱恩永, 刘丽婷, 杨嘉麒, 汪雁楠, 莫晓勇. 芒萁组培技术体系的优化[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(2): 107-114.

美国山核桃种质资源遗传多样性ISSR分析

Genetic diversity and identification of pecan by ISSR markers

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

作者

读者

审稿