南京林业大学学报(自然科学版) ›› 1999, Vol. 23 ›› Issue (05): 89-89.doi: 10.3969/j.jssn.1000-2006.1999.05.020
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高捍东
摘要: <正>应用RAPD 分子标记手段,研究板栗品种的遗传多样性,建立了板栗品种RAPD 标记的标准程序,以及板栗品种的DNA 指纹数据库,为板栗育种提供理论依据,并为板栗品种鉴别提供了准确、可靠的标准方法,主要结果与结论如下:1板栗营养体中酚类化合物和单宁物质含量高,DNA 提取和纯化非常困难。本研究对CTAB 法加以改良,总结出能够产生扩增产物的模板DNA 提取和纯化方法。2建立了稳定的板栗DNA 扩增反应体系。并对影响RAPD 反应效果和特异性的两个关键因子,即对退火温度和镁离子浓度进行研究。板栗DNA 扩增反应体系中,反应体积为20 μL。94 ℃预变性2 min ,然后执行38 个扩增循环,每个循环中,94 ℃变性30 s,72 ℃延伸90 s,最后72 ℃延伸7 min 。从S系列的S1 ~S100 共100 个引物中筛选出适合板栗基因组DNA,能够扩增出稳定产物、扩增谱带清晰、特异性强的16 个引物供板栗品种RAPD 分析用。16 个引物扩增的位点总数为119 个,特异性多态位点69 个,多态位点占总数的58 % 。3研究品种间的遗传多样性。46 个板栗品种样品的DNA,用16 个引物进行扩增反应,产生69 个多态位点。研究结果表明,各个位点上遗传多样性程度存在较大差别,有效等位基因数目(Ne) 最大值为19990 ,最小值为1044 4 ;基因多样度(H) 的最大值为0499 8 ,最小值为00425 ;Shannon 信息指数的最大值为06929 ,最小值为01047 。所检测位点的平均有效等位基因数目为1526 0 ,平均基因多样度为03618 ,平均信息指数为0 .843 2 。有效等位基因数目、平均基因多样度和平均Shannon 信息指数的标准误都较小,分别为0 .309 6 、01418 、0174 8 ,估计精度较高。这三个遗传多样性度量表明板栗品种间具有较高的遗传多样性。品种间遗传距离最大值为0800 1,相应的遗传共享度为04493 ;品种间遗传距离最小值为00910 ,对应的遗传共享度为0913 0 。遗传距离是评价品种间近缘关系的良好指标。4本研究建立了46 个板栗品种的DNA 指纹数据库,并分析出这些板栗品种分子鉴别的最优化引物组合。结果表明,采用16 个能产生特异扩增产生的引物中的4 个引物,即可准确鉴别所研究的46 个板栗品种。分子分类能够有效地揭示形态相似、经济性状相近或部分地理种源相同的品种间的近缘关系。分子标记方法鉴别品种具有广阔的前景。
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