果梅RAPD标记不同电泳指纹比较及

李晓颖; 宋长年; 张彦苹; 王玉娟; 章镇; 房经贵

doi:10.3969/j.jssn.1000-2006.2010.05.006

果梅RAPD标记不同电泳指纹比较及

李晓颖，宋长年，张彦苹，王玉娟，章镇，房经贵

南京林业大学学报（自然科学版） ›› 2010, Vol. 34 ›› Issue (05) : 29-33.

PDF(919758 KB)

国家林草科技领军期刊
中国精品科技期刊
中国高校百佳科技期刊
江苏省新闻出版政府奖期刊奖
RCCSE林学权威期刊（A+）
CSCD核心期刊
Scopus数据库收录期刊
中文核心期刊
SCD核心期刊

作者加群：102861116

微信公众号：南京林业大学学报

高级检索

PDF(919758 KB)

南京林业大学学报（自然科学版） ›› 2010, Vol. 34 ›› Issue (05) : 29-33. DOI: 10.3969/j.jssn.1000-2006.2010.05.006

研究论文

果梅RAPD标记不同电泳指纹比较及

李晓颖，宋长年，张彦苹，王玉娟，章镇，房经贵¹

作者信息 +

Comparison of RAPD fingerprints of fruiting mei generated by different electrophoresis and characterization of the amplified sequences

LI Xiaoying, SONG Changnian, ZHANG Yanping, WANG Yujuan, ZHANG Zhen, FANG Jinggui^*

Author information +

文章历史 +

摘要

利用11个碱基引物, 在对退火温度等反应条件进行严格优化的基础上，以不同品种果梅为材料，同时利用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳检测了RAPD扩增产物。结果表明：PAGE电泳检测出的谱带总数量以及多态性谱带的数量分别为204和145，以琼脂糖凝胶检测的为91和58。根据PAGE电泳系统获得的标记信息对16个果梅品种进行聚类分析，表明所有品种都能被很好地区分，并在一定程度上反映了果梅品种的亲缘关系。通过对20个随机挑选的扩增片段进行克隆与测序发现，20个片段都是对应引物的RAPD扩增产物，在不同的16个序列中有4条是编码蛋白的基因片段，说明了RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列，同时可以扩增编码蛋白的基因片段，是对基因组不同区域的随时机扩增，所以能够客观地反映不同果梅品种间的遗传差异。

Abstract

PCR amplification was conducted with 11 bp primers by the optimized RAPD protocol and we used agarose and polyacrylamide gel (PAGE) electrophoresis to detect RAPD amplification products from 16 fruiting mei cultivars. The results showed that the total and polymorphic bands of PAGE were 204 and 145, while 91 and 58 on agarose gel. The polygenetic tree also showed that all the 16 cultivars could be distinguished unambiguously and their relationship was revealed according to the fingerprinting profiles obtained by PAGE electrophoresis system. Random cloning and sequencing of 20 amplified fragments showed that all these segments were RAPD products generated by the corresponding primers. Among the sequenced fragments, four sequences were from protein coding regions, suggesting RAPD could randomly amplify both coding and noncoding sequences. Thus, genetic variability of different fruiting mei cultivars could be properly reflected by RAPD marker.

引用本文

EndNote

Ris (Procite)

Bibtex

导出引用

李晓颖，宋长年，张彦苹，王玉娟，章镇，房经贵. 果梅RAPD标记不同电泳指纹比较及[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）. 2010, 34(05): 29-33 https://doi.org/10.3969/j.jssn.1000-2006.2010.05.006

LI Xiaoying, SONG Changnian, ZHANG Yanping, WANG Yujuan, ZHANG Zhen, FANG Jinggui. Comparison of RAPD fingerprints of fruiting mei generated by different electrophoresis and characterization of the amplified sequences[J]. JOURNAL OF NANJING FORESTRY UNIVERSITY. 2010, 34(05): 29-33 https://doi.org/10.3969/j.jssn.1000-2006.2010.05.006

中图分类号： S722

参考文献

[1]Williams J G K, Kubelik A R, Livak K J, et al. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers[J]. Nucl Acids Res, 1990, 18(22): 6531-6535. [2]Lin K H, Lai Y C, Li H C. Genetic variation and its relationship to root weight in the sweet potato as revealed by RAPD analysis[J]. Scientia Horticulturae, 2009, 120(1): 2-7. [3]An N, Guo H B, Ke W D. Genetic variation in Rhizome Lotus (Nelumbo nucifera Gaertn.ssp.nucifera) germplasms from China assessed by RAPD markers[J]. Agricultural Sciences in China, 2009, 8(1): 31-39. [4]Yang R W, Zhou Y H, Ding C B, et al. Relationships among Leymus species assessed by RAPD markers[J]. Biologia Plantarum, 2008, 52(2): 237-241. [5]Ozakit, Shimada T, Nakanishi T, et al. RAPD analysis for parentage determination in Prunus mume Sieb.Et Zucc.[J]. Japan Soc Hort Sci, 1995, 64(2): 235-242. [6]Shimada T H T, Yamaguchi T. Classification of mume (Prunus mume Sieb.et Zucc.) by RAPD assay[J]. J Japan Soc Hort Sci, 1994, 63(3): 543-551. [7]房经贵,章镇,蔡斌华,等. 果梅品种分类研究进展[J]. 江苏林业科技,2009,36(3):44-50. [8]房经贵,章镇,周兰华. RAPD标记鉴定果树芽变的可行性分析[J]. 果树学报,2001,18(3):182-185. [9]于华平,房经贵,张美勇,等. RAPD标记用于葡萄、苹果等7种果树的品种鉴定的研究[J]. 江西农业学报,2009,21(10):5-9. [10]房经贵,王晨,章镇,等. 浅谈中国果树品种权益保护及其现状[J]. 中国农学通报,2009,25(24):298-302. [11]佟兆国,王富荣,章镇,等. 一种从果树成熟叶片提取DNA的方法[J]. 果树学报2008,25(1):122-125. [12]刘勇,吴波,孙中海,等. 江西柑橘地方品种资源及野生近缘种SSR分子标记[J]. 江西农业大学学报,2005,27(4):486-490. [13]程中平,陈志伟,胡春根,等. 利用RAPD技术对新疆桃分类地位的探讨[J]. 园艺学报,2001,28(3):211-217. [14]程中平,陈志伟,胡春根,等. 油桃品种的RAPD分析[J]. 中国农业大学学报,2002,7(3):63-68. [15]乔玉山,章镇,房经贵,等. 中国李RAPD的优化反应体系及其在品种鉴定中的应用[J]. 果树学报,2003,20(6):445-449. [16]吴少华,张大生,潘东明,等. 应用RAPD技术对柰、李、桃亲缘关系的探讨[J]. 园艺学报,2002,29(1):66-68. [17]张俊卫,包满珠,陈龙清,等. 桃、梅、李、杏、樱的RAPD分析[J]. 北京林业大学学报,1998,20(2):16-19. [18]高志红,章镇,盛炳成,等. 桃、梅、李、杏四种主要核果类果树RAPD指纹图谱初探[J]. 果树学报,2001,18(2):120-121. [19]陈晓流,陈学森,束怀瑞,等. 15个樱桃品种的RAPD分析[J]. 果树学报,2004,21(6):556-559. [20]程中平,陈志伟,胡春根,等. RAPD技术在桃种质资源保存中的应用[J]. 中国果树,2002(3):5-7. [21]程中平,陈志伟,胡春根,等. 利用RAPD标记对桃品种特殊种质分析[J]. 果树学报,2001,18(4):217-220. [22]乔飞,王力荣,范崇辉,等. 利用RAPD标记评价桃种间杂交一代群体的分离方式[J]. 果树学报,2003,20(4):310-312. [23]冉辛拓,冯志红,于丽辰,等. 利用RAPD方法确认“重阳红”桃及其芽变[J]. 园艺学报,2005,32(4):593.

基金

收稿日期：2010-01-11修回日期：2010-04-26基金项目：国际青年基金项目(IFS)(D/3232-1); 2008年江苏省“青蓝工程”人才培育计划项目作者简介：李晓颖(1987—),博士生。*房经贵(通信作者),教授。Email: fanggg@njau.edu.cn。引文格式：李晓颖，宋长年，张彦苹,等. 果梅RAPD标记不同电泳指纹比较及扩增产物序列分析[J]. 南京林业大学学报:自然科学版,2010,34(5):29-33.