油茶苯丙氨酸解氨酶基因的cDNA克隆与序列分析

田晓明; 谭晓风; 胡孝义; 刘巧; 罗茜

doi:10.3969/j.jssn.1000-2006.2009.04.005

田晓明，谭晓风*，胡孝义，刘巧，罗茜

南京林业大学学报（自然科学版） ›› 2009, Vol. 33 ›› Issue (04) : 24-28.

PDF(1461785 KB)

国家林草科技领军期刊
中国精品科技期刊
中国高校百佳科技期刊
江苏省新闻出版政府奖期刊奖
RCCSE林学权威期刊（A+）
CSCD核心期刊
Scopus数据库收录期刊
中文核心期刊
SCD核心期刊

作者加群：102861116

微信公众号：南京林业大学学报

高级检索

PDF(1461785 KB)

南京林业大学学报（自然科学版） ›› 2009, Vol. 33 ›› Issue (04) : 24-28. DOI: 10.3969/j.jssn.1000-2006.2009.04.005

研究论文

油茶苯丙氨酸解氨酶基因的cDNA克隆与序列分析

田晓明，谭晓风*，胡孝义，刘巧，罗茜

作者信息 +

Molecular clone and sequence analysis of phenylalanine ammonia lyase gene from Camellia oleifera

TIAN Xiaoming, TAN Xiaofeng*, HU Xiaoyi, LIU Qiao, LUO Qian

Author information +

文章历史 +

摘要

苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia lyase, PAL)是苯丙烷类代谢途径的关键酶之一。以油茶(Camellia oleifera)近成熟种子cDNA文库和EST文库为材料，通过分子克隆方法鉴定了PAL全长cDNA。结果表明：油茶PAL基因的cDNA长2 118 bp，编码705个氨基酸，与其他物种的PAL具有较高的相似性，在进化上高度同源；油茶PAL编码的蛋白质序列包含与水稻、玉米PAL蛋白质相同的脱氨基位点和催化活性位点；PAL系统进化树表明, 油茶PAL基因与灌木类植物的PAL基因聚类关系最近。

Abstract

PAL (phenylalanine ammonia lyase) is one of the key enzymes in plant secondary metabolism. The fulllength cDNA of PAL was identified from the cDNA library and EST library of Camellia oleifera by the method of molecular cloning in this paper. The results showed that the cDNA of C.oleifera PAL contained 2 118 bp, encoding 706 amino acids, and had a high similarity in the evolution of a high degree of homology with other species of PAL; C.oleifera PAL encoded protein sequence contained the same deamination site and catalytic active site with protein PAL of rice and corn. PAL phylogenetic tree analyses revealed that the C. oleifera PAL had closer relationship with PALs from Shrub plants than from other plants.

引用本文

EndNote

Ris (Procite)

Bibtex

导出引用

田晓明，谭晓风*，胡孝义，刘巧，罗茜. 油茶苯丙氨酸解氨酶基因的cDNA克隆与序列分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）. 2009, 33(04): 24-28 https://doi.org/10.3969/j.jssn.1000-2006.2009.04.005

TIAN Xiaoming, TAN Xiaofeng*, HU Xiaoyi, LIU Qiao, LUO Qian. Molecular clone and sequence analysis of phenylalanine ammonia lyase gene from Camellia oleifera[J]. JOURNAL OF NANJING FORESTRY UNIVERSITY. 2009, 33(04): 24-28 https://doi.org/10.3969/j.jssn.1000-2006.2009.04.005

中图分类号： Q785

参考文献

[1]江昌俊,余有本. 苯丙氨酸解氨酶的研究进展[J]. 安徽农业大学学报,2001,28(4):425-430.
[2]程水源,陈昆松,刘卫红,等. 植物苯丙氨酸解氨酶基因的表达调控与研究进展[J]. 果树学报,2003,20(5):351-357.
[3]张党权,谭晓风,陈鸿鹏. 油茶油脂的生物合成及调控基因的特性[J]. 中南林业科技大学学报,2008,27(10):106-112
[4]张党权,谭晓风,陈鸿鹏,等. 油茶SAD基因的全长cDNA克隆及生物信息学分析[J]. 林业科学2008,44(2):155-160.
[5]胡芳名,谭晓风,石明旺,等. 油茶种子cDNA文库构建[J]. 中南林学院学报,2004,24(5):1-4.
[6]谭晓风,胡芳名,谢禄山,等. 油茶种子EST文库构建及主要表达基因的分析[J]. 林业科学,2006,42(1):43-48.
[7]萨姆布鲁克J,拉塞尔D W. 分子克隆实验指南[M]. 2版. 北京:科学出版社,1999. [8]许锋,陈柳吉,蔡荣,等. 海桐花苯丙氨酸解氨酶的基因克隆与序列分析[J]. 西北农业学报,2008,17(2):218-224.
[9]谭晓风,陈鸿鹏,张党权,等. 油茶FAD2基因全长cDNA的克隆和序列分析[J]. 林业科学,2008,44(5):70-76.
[10]Tan X F, Zhang D Q, Qiu J, et al. Separation and bioinformatic analysis of oleosin genes in seeds of Camellia oleifera[R]. The Third International Forum on PostGenome Technologies, 2005: 90-91.
[11]陈新,万德光,严铸云,等. 银杏苯丙氨酸解氨酶(PAL)的基因克隆[J]. 成都中医药大学学报,2004,27(1)31-34.
[12]王燕,张风霞,朱俊,等. 核桃苯丙氨酸解氨酶的基因克隆与序列分析[J]. 湖北农业科学,2008,22(6):622-626.
[13]KUMAR S, TAMURA K, NEI M. MEGA3. Integrated software for molecular evolutionary genetics analysis and sequence alignment [J]. Briefings in Bioinformatics, 2004, 5(2): 150-163.
[14]陈鸿鹏,谭晓风. 超氧化物歧化酶(SOD)研究综述[J]. 经济林研究,2007,25(1):59-65.
[15]ROSLER J, KREKEL F, AMRHEIN N, et al. Maize phenylalanine ammonialyase has tyrosine ammonialyase activity[J]. Plant Physiol, 1997, 113(1): 175-179.
[16]Pedroso MC, MagalhaesJR, Durzan D. Nitric oxide induces cell death in Taxus cells[J]. Plant Sci, 2000, 157(11): 173-180.
[17]胡孝义,谭晓风,田晓明,等. 油茶种子水通道蛋白CoPIP121的鉴定与分析[J]. 林业科学,2008,44(12):48-57.
[18]胡孝义,谭晓风,张党权,等. 1个油茶Y2SK2 型脱水素的全长cDNA克隆及生理功能的预测[J]. 林业科学,2008,44(10):56-64.

基金

收稿日期：2008-11-18修回日期：2009-03-09基金项目：国家自然科学基金资助项目(30371184)；湖南省自然科学基金资助项目(05JJ40125)作者简介：田晓明(1986—)，硕士生。*谭晓风(通讯作者)，教授，研究方向为经济林栽培育种与林业生物技术。Email: tanxiaofencn@yahoo.com.cn。引文格式：田晓明,谭晓风,胡孝义,等. 油茶苯丙氨酸解氨酶基因的cDNA克隆与序列分析[J]. 南京林业大学学报:自然科学版,2009,33(4):24-28.