南京林业大学学报(自然科学版) ›› 2010, Vol. 34 ›› Issue (03): 35-38.doi: 10.3969/j.jssn.1000-2006.2010.03.008
尹佟明
出版日期:
2010-06-29
发布日期:
2010-06-29
基金资助:
YIN Tongming
Online:
2010-06-29
Published:
2010-06-29
摘要: 数量基因位点(quantitative trait loci, QTL)分析是利用图位法克隆控制数量性状主效基因的前提和基础 。采用BoxCox公式进行数据正态转换对提高QTL分析效率有显著作用。笔者以杨树为实例显示了BoxCox公式在数据正 态转变中的应用及数量性状表型分布对QTL分析的影响。结果发现,数据是否符合正态分布对发现控制数量性状的基 因位点有显著影响。如果不对性状的表型值进行分布检测并进行正态转变,可能无法发现某些有显著效应的遗传位 点。通过比对转化前后QTL分析的LOD值变化曲线得知,曲线变化的趋势在转化前后是一致的,曲线上各个小峰的位 置也是稳定的,但转化后LOD峰值显著提高。如第4染色体上,转化前后LOD值变化曲线上在40~60、80~100及130~150 cm区间均有3个独立峰值出现,数据转化后对应峰值升高,其中第1个峰的峰值约增加3倍,数据转化后该峰值LOD支 持度达到了极显著水平,显示该位置存在一个控制该性状的较强的遗传位点。第8染色体上也出现相似的情况。
中图分类号:
尹佟明. BoxCox变换对数量性状基因座位检测效率的影响[J]. 南京林业大学学报(自然科学版), 2010, 34(03): 35-38.
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