南京林业大学学报(自然科学版) ›› 2023, Vol. 47 ›› Issue (5): 80-86.doi: 10.12302/j.issn.1000-2006.202110046
罗芊芊1,2(), 李峰卿3, 肖德卿2, 邓章文1, 王建华1, 周志春2,*(
)
收稿日期:
2021-10-23
修回日期:
2022-05-12
出版日期:
2023-09-30
发布日期:
2023-10-10
通讯作者:
*周志春(作者简介:
罗芊芊(基金资助:
LUO Qianqian1,2(), LI Fengqing3, XIAO Deqing2, DENG Zhangwen1, WANG Jianhua1, ZHOU Zhichun2,*(
)
Received:
2021-10-23
Revised:
2022-05-12
Online:
2023-09-30
Published:
2023-10-10
摘要:
【目的】研究南方红豆杉(Taxus wallichiana var. mairei)天然居群的交配系统,揭示浙江龙泉和江西分宜天然居群的交配机制以及亲代间的遗传多样性差异,为南方红豆杉的科学保育和遗传资源有效利用提供理论参考。【方法】以浙江龙泉和江西分宜天然居群亲代及其子代为研究对象,运用12对SSR引物对71个亲代及8个采种母株的104个子代进行分析。【结果】参试的浙江龙泉和江西分宜居群亲代的等位基因数(Na)皆为7,2个参试居群的有效等位基因数(Ne)分别为4.831和3.552,浙江龙泉居群较江西分宜居群高出1.279个有效等位基因。2个参试居群的观测杂合度(Ho)均小于期望杂合度(He),且固定指数(F)大于0。浙江龙泉居群的等位基因丰富度和私有等位基因丰富度(AR=4.195,PA=1.832)皆大于江西分宜居群(AR=3.576,PA=1.647)。2个参试居群的遗传多样性略有差异,但仍具有较高的遗传多样性。多位点交配系统分析(MLTR)结果表明,浙江龙泉和江西分宜居群中,南方红豆杉的异交率较高(tm=1.200)。单位点和多位点父本相关性的差值[rp(s)-rp(m)]为0.095,亲代居群内存在近交现象,但近交水平较低(
中图分类号:
罗芊芊,李峰卿,肖德卿,等. 两个南方红豆杉天然居群的交配系统分析[J]. 南京林业大学学报(自然科学版), 2023, 47(5): 80-86.
LUO Qianqian, LI Fengqing, XIAO Deqing, DENG Zhangwen, WANG Jianhua, ZHOU Zhichun. Mating system analyses of two natural populations of Taxus wallichiana var. mairei[J].Journal of Nanjing Forestry University (Natural Science Edition), 2023, 47(5): 80-86.DOI: 10.12302/j.issn.1000-2006.202110046.
表1
南方红豆杉天然居群取样母株基本信息"
居群代号 population code | 采样地 seed collection site | 东经 longtitude (E) | 北纬 latitude (N) | 海拔/m altitude | 亲代数目 number of adults | 亲代性别 比例(♀/♂) female/male of parental plants | 采种母株数 number of mother plants collected | 采集叶样的 子代数 number of progeny of leaf samples collected |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ZJLQ | 浙江龙泉 Longquan,Zhejiang | 118°47'48″ | 28°0'36″ | 585~772 | 22 | 13/9 | 5 | 78 |
JXFY | 江西分宜 Fenyi, Jiangxi | 114°32'39″ | 27°37'17″ | 241~624 | 49 | 6/43 | 3 | 26 |
表2
12对引物的基本信息"
引物 primer | 序列sequence(5'-3') | 片段 大小/bp size range | 退火温度/℃ annealing temperature | 参考文献 reference |
---|---|---|---|---|
S7 | F:ACCCCATAGTTCAGGGTCGA | 149~292 | 57 | [ |
R:AGAAGGAGGCTCGGCTCTAA | ||||
S24 | F:TGCTTAGAGAAGAAAGTTTTCCA | 145~312 | 54 | [ |
R:TGGCATACAAGAGGCTGACA | ||||
S34 | F:ATAACCATCACACGTGACTTGC | 193~300 | 57 | [ |
R:TGAACCCTAGGTGACGACCAT | ||||
S36 | F:TGGTTTACATATTGAAGCGAGCAA | 109~176 | 55 | [ |
R:GCAGCGAAACATATGTAGCACAA | ||||
S41 | F:GGACAAGGGTTGGATCACTTCTGT | 203~294 | 61 | [ |
R:CCAACGGCCACCCGAAGAGT | ||||
S44 | F:TGACAACACAACCACACAATGTCCA | 133~375 | 57 | [ |
R:TCTTGTTTTCTGGGCCTAAAGTGT | ||||
S45 | F:GCGCTAGTCCTCAGTGGTGCC | 134~272 | 63 | [ |
R:GCGCCGGGGCCAACTAAACT | ||||
S64 | F:GCATTCTGCTCCTGAGTGTGGCA | 223~397 | 61 | [ |
R:AGTAGTCTATCCTCGTCTCCTCCCA | ||||
S77 | F:CCAATGTGGGCTACATCCACC | 178~357 | 58 | [ |
R:ATTGTAATAGCATGGATAAGTGCCC | ||||
S79 | F:AGTTTGCATGCTCTTCAACCTAGT | 176v249 | 57 | [ |
R:AGGCAGAATCGGTGAGTGGTT | ||||
S82 | F:TGTCGCATCGAGGACGATGCTTTC | 201~434 | 62 | [ |
R:CATGGCGGCGGCAGTTCTTG | ||||
S93 | F:CAGGGCTCAAATTCGCGGGC | 147~195 | 62 | [ |
R:CCGCCTGGCGTTTGACAGGA |
表4
2个南方红豆杉天然居群的交配系统参数"
居群 population | tm | ts | rp(m) | rp(s) | rp(s) - rp(m) | Nep | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
ZJLQ | 1.200(0.000) | 1.035(0.029) | 0.165(0.029) | 0.706(0.098) | 0.501(0.111) | -0.205(0.078) | 1.4 |
JXFY | 1.200(0.000) | 0.804(0.040) | 0.396(0.040) | 0.515(0.133) | 0.999(0.121) | 0.484(0.117) | 1.9 |
总体水平total | 1.200(0.000) | 0.932(0.018) | 0.268(0.018) | 0.660(0.085) | 0.755(0.098) | 0.095(0.060) | 1.5 |
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