miR164a及其靶基因PeNAC1相互作用研究

doi:10.3969/j.issn.1000-2006.2016.05.005

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南京林业大学学报（自然科学版） ›› 2016, Vol. 59 ›› Issue (05): 29-33.doi: 10.3969/j.issn.1000-2006.2016.05.005

miR164a及其靶基因PeNAC1相互作用研究

王浩然,李爽爽,乐丽娜,匡华琳,黄敏仁,陈英^*

南方现代林业协同创新中心,南京林业大学林学院,江苏省农业种质资源保护与利用平台杨树种质资源圃,江苏南京 210037

出版日期:2016-10-18 发布日期:2016-10-18
基金资助:
收稿日期:2015-12-23 修回日期:2016-05-13
基金项目:国家林业公益性行业科研专项青年项目(20134111); 国家自然科学基金青年项目(31200507); 江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)
第一作者:王浩然(njlydxwhr@163.com)。*通信作者:陈英(ychen@ njfu.edu.cn),副教授。
引文格式:王浩然,李爽爽,乐丽娜,等. miR164a及其靶基因PeNAC1相互作用研究[J]. 南京林业大学学报(自然科学版),2016,40(5):29-33.

Interaction between miR164a and its target PeNAC1

WANG Haoran, LI Shuangshuang,LE Lina,KUANG Hualin,HUANG Minren,CHEN Ying^*

Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, College of Forestry, Nanjing Forestry University, Poplar Germplasm Nursery, Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilizations for Agricultural Germplasm, Nanjing 210037, China

Online:2016-10-18 Published:2016-10-18

摘要/Abstract

摘要： miRNA参与了生物体重要的基因表达调控过程,其中miR164通过对标靶NAC(NAM/ATAF/CUC)基因家族的精细调控,在植物激素信号传导、生长发育以及胁迫应答中起着重要作用。为了验证杨树中miR164a和其预测靶基因PeNAC1间是否也存在这一相互作用,笔者采用PCR技术克隆了毛果杨(Populus trichocarpa)miR164a的前体序列Ptc-MIR164a,并通过RNA fold(http://rna.tbi.univie.ac.at/)在线软件对其进行了miRNA二级结构分析。结果表明:该序列能形成典型的二级茎环结构,预示其在细胞内能被加工为成熟的miR164a。进一步借鉴动物细胞miRNA研究中荧光素酶报告基因法,利用高效的杨树原生质体瞬时表达体系,验证了Ptc-MIR164a对其预测靶基因PeNAC1的标靶作用; 同时,也建立了一种比较简单、直观的植物miRNA靶标基因的鉴定方法。

Abstract: miRNA plays a central role in gene regulations. Many research showed that miR164a targets NAC(NAM/ATAF/CUC)genes involved in multiple biological functions, such as plant development, hormones singal transduction and environmental stimuli. To confirm the interaction between micro164a and its predicted target gene PeNAC1 in poplar, the pre-micro164a sequence was cloned from P. trichocarpa genome DNA by PCR, named Ptc-MIR164a. And according to the results of secondary structure analyses with RNA fold(http://rna.tbi.univie.ac.at/), Ptc-MIR164a can form a typical stem-loop structure that suggests it can be processed into mature miRNA164a in vivo. Then combining the principle of luciferase reporter plasmids used in miRNA target detection in animal cell and the transient expression system of poplar protoplasts, we confirmed the interaction between Ptc-MIR164a and PeNAC1 and established a simple and intuitive method for miRNA target detection in plant cell.

中图分类号:

S722
Q343

王浩然,李爽爽,乐丽娜,等. miR164a及其靶基因PeNAC1相互作用研究[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2016, 59(05): 29-33.

WANG Haoran, LI Shuangshuang,LE Lina,KUANG Hualin,HUANG Minren,CHEN Ying. Interaction between miR164a and its target PeNAC1[J].Journal of Nanjing Forestry University (Natural Science Edition), 2016, 59(05): 29-33.DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.2016.05.005.

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