利用ISSR和SRAP标记分析油茶遗传多样性

doi:10.3969/j.jssn.1000-2006.2012.05.003

国家林草科技领军期刊
中国精品科技期刊
中国高校百佳科技期刊
江苏省新闻出版政府奖期刊奖
RCCSE林学权威期刊（A+）
CSCD核心期刊
Scopus数据库收录期刊
中文核心期刊
SCD核心期刊

作者加群：102861116

微信公众号：南京林业大学学报

高级检索

南京林业大学学报（自然科学版） ›› 2012, Vol. 36 ›› Issue (05): 19-25.doi: 10.3969/j.jssn.1000-2006.2012.05.003

利用ISSR和SRAP标记分析油茶遗传多样性

彭方仁¹，吴莺莺¹，郝明灼¹，陈隆升²，陈永忠²

1.南京林业大学森林资源与环境学院，江苏南京210037；
2.湖南省林业科学研究院，湖南长沙 410004

出版日期:2012-09-30 发布日期:2012-09-30
基金资助:
收稿日期：2011-01-26修回日期：2011-09-08
基金项目：“十一五”国家科技支撑计划（2009BADB1B04）
第一作者：彭方仁，教授，博士。E-mail: frpeng@njfu.edu.cn。
引文格式：彭方仁，吴莺莺，郝明灼,等. 利用ISSR和SRAP标记分析油茶遗传多样性[J]. 南京林业大学学报:自然科学版,2012,36(5):19-25.

Genetic diversity of Camellia oleifera using ISSR and SRAP markers

PENG Fangren¹，WU Yingying¹， HAO Mingzhuo¹，CHEN Longsheng²， CHEN Yongzhong²

1.College of Forest Resource and Environment, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China; 
2. Forestry Science Academy of Hunan Prefecture, Changsha 410004, China

Online:2012-09-30 Published:2012-09-30

摘要/Abstract

摘要： 利用ISSR和SRAP分子标记对192份油茶种质材料的遗传多样性进行了分析。其中，以ISSR标记筛选出10条引物，共扩增出118个位点，多态性位点104个，多态性百分率88.14 %，相似系数为0.52～1.00；以SRAP标记挑选了12对引物，共扩增出284个位点，多态性位点244个，多态性百分率85.37 %，相似系数为0.65～0.95。对ISSR、SRAP以及二者的混合数据形成的3个遗传相似矩阵进行相关性研究，得到ISSR和SRAP、ISSR和综合数据以及SRAP和综合数据之间均呈极显著相关，说明这两种分子标记对油茶种质材料的遗传多样性分析具有较高的一致性，且SRAP标记具有更高的可信度。聚类分析发现，以ISSR标记在相似系数为0.68时可划分为6个类群，以SRAP标记在相似系数为0.70时也划分为6个类群,且这些油茶种质材料间的亲缘关系较近。但由聚类分析划分的油茶类群来看，这些油茶种质材料遗传背景又比较复杂，具有丰富的遗传多样性。

Abstract: In this paper, two kinds of molecular markers, ISSR and SRAP were used to assess the genetic diversity in 192 accessions of Camellia oleifera. Ten primers were screened from 100 primers of ISSR, 118 bands were amplified, among which 104 bands were polymorphic bands, the percentage of polymorphic band was 8814 %, the Neis genetic similarity coefficients ranged from 052 to 100. Twelve pairs primers of SRAP were selected out, 284 bands were amplified, of which 244 bands (85.37 %) were polymorphic, and the Neis genetic similarity coefficients ranged from 065 to 095. The correlation of the genetic similarity matrix among the ISSR, SRAP and the combination data were higher. It indicated that the two methods had highly consistent in the genetic diversity analysis of C. oleifera, furthermore the SRAP technique was more reliable. According to the UPGMA method, we made the cluster analysis by using the NTSYS software. The 192 germplasms of C. oleifera could be divided into 6 groups at the similarity coefficient of 068 by ISSR marker; they also could be divided into 6 groups at the similarity coefficient of 070 by SRAP marker. This indicated that the C. oleifera germplasms had close relationship. However, the dendrograms cluster analysis showed that some germplasms probably represent different genetic background and high genetic diversity.

中图分类号:

S722

彭方仁,吴莺莺,郝明灼,等. 利用ISSR和SRAP标记分析油茶遗传多样性[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2012, 36(05): 19-25.

PENG Fangren，WU Yingying， HAO Mingzhuo，CHEN Longsheng， CHEN Yongzhong. Genetic diversity of Camellia oleifera using ISSR and SRAP markers[J].Journal of Nanjing Forestry University (Natural Science Edition), 2012, 36(05): 19-25.DOI: 10.3969/j.jssn.1000-2006.2012.05.003.

参考文献

[1]阙龙善,张国武,杜天真.中国油茶技术研究与产业发展战略探讨[J].江西科学,2007,25(4):505-510.
[2]胡永南,游美红,袁胜贵,等.不同配方施肥对幼龄油茶的影响[J].西北林学院学报,2005,20(1):94-97.
[3]奚如春,邓小梅.我国油茶产业化发展中的现状、要素及其优化[J].经济林研究,2005,23(1):83-87.
[4]张乃燕,蒙敬彪,江泽鹏,等.广西油茶杂交育种研究现状与发展思路[J].林业科技开发,2008,22(3):6-9.
[5]黄永芳,陈锡沐,庄雪影,等.油茶种质资源遗传多样性分析[J].林业科学,2006,42(4):38-43.
[6]黄永芳,陈锡沐,雷治国,等.油茶种质资源RAPD分析[J].河南农业科学,2004（12）:22-25.
[7]张云.油茶遗传多样性及遗传性状的RAPD分析[D].福州：福建师范大学,2003.
[8]王保明,陈永忠,谭晓风,等.应用ISSR分析油茶无性系的遗传多样性[J].东北林业大学学报,2008,36(6):19-23，36.
[9]陈永忠,杨小胡,彭邵锋,等.我国油茶良种选育研究现状及发展策略[J].林业科技开发,2005,19(4):1-4.
[10]汤晓文,刘韶辉,田亚玲,等.我国油茶产业发展现状及对策[J].林业科技,2008（7）:24-28.
[11]张国武,钟文斌,乌云塔娜,等.油茶优良无性系ISSR分子鉴别[J].林业科学研究,2007,20(2):278-282.
[12]张智俊.油茶优良无性系组织培养、RAPD分子鉴别和cDNA文库构建的研究[D].长沙:中南林学院,2003.
[13]郑婷婷,林萍,王开良,等.油茶SRAP-PCR反应体系的优化[J].林业科学研究,2010,23(2):302-307.
[14]林萍,姚小华,王开良,等.油茶长林系列优良无性系的SRAP分子鉴别及遗传分析[J].农业生物技术学报,2010,18(2):272-279.
[15]刁英,胡小虎,郑兴飞,等.利用SRAP和ISSR标记分析五节芒的遗传多样性[J].武汉大学学报：理学版,2010,56(5):578-583.
[16]郭凌飞.应用ISSR和SRAP标记研究澳洲坚果的遗传多样性[D].海口：海南大学,2008.
[17]沈程文,黄建安,赵世浩,等.利用SRAP和ISSR标记分析广东茶树种质资源的遗传多样性[J].核农学报,2010,24(5):948-955.
[18]郑鹭.蓖麻种质资源鉴定评价及遗传多样性ISSR与SRAP分析[D].福州：福建农林大学,2007.
[19]Li L, Peng J Y, Bai R X. Analysis of the genetic relationships in Chinese ziziphus with SRAP markers[J]. Scientia Agricultora Sinica, 2009, 42(5):1713-1719.
[20]Li A, Ge S. Genetic variation and clonal diversity of Psammochloa villosa detected by ISSR markers[J]. Annals of Botany, 2001, 87(5): 585-590.
[21]Pan D, Yu M W, Guo Y C, et al. Sequencerelated amplified polymorphism (SRAP) of wild emmer wheat (Triticum dicoccoides) in Israel and its ecological association[J]. Biochemical Systematics and Ecology, 2010, 38(1):1-11.

相关文章 15

[1]	马坛, 田野, 王书军, 李文昊, 段启英, 张庆源. 不同性别南方型黑杨无性系叶片对土壤短期间歇性干旱的生理响应[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(3): 172-180.
[2]	王改萍, 章雷, 曹福亮, 丁延朋, 赵群, 赵慧琴, 王峥. 红蓝光质对银杏苗木生长生理特性及黄酮积累的影响[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(2): 105-112.
[3]	宋子琪, 卞国良, 林峰, 胡凤荣, 尚旭岚. 流式细胞仪鉴定青钱柳倍性方法的建立及其应用[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(2): 61-68.
[4]	孙旭高, 陶家璐, 谢微, 石洁, 张宝津, 邓小梅. 米老排优树组培技术体系优化研究[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(2): 69-78.
[5]	顾宸瑞, 袁启航, 姜静, 穆怀志, 刘桂丰. 基于转录组测序的关联分析定位裂叶桦叶形调控基因[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(1): 39-46.
[6]	杨蕴力, 曹俐, 王阳, 顾宸瑞, 陈坤, 刘桂丰. BpGLK1基因干扰表达对裂叶桦叶色及生长的影响[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(1): 18-28.
[7]	王伟, 邱志楠, 李爽, 白向东, 刘桂丰, 姜静. CRISPR/Cas9核糖核蛋白介导的无T-DNA插入的白桦BpGLK1精准突变[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(1): 11-17.
[8]	国颖, 杨港归, 吴雨涵, 何杰, 何玉洁, 廖浩然, 薛良交. DNA甲基化调控植物组织培养过程的分子机制研究进展[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(6): 1-8.
[9]	陈俊娜, 王晓宇, 陈晨, 彭辉武, 陈娟, 黄卫和, 喻方圆. BR对东京野茉莉种子中脂肪酸合成相关酶活性及油脂积累的影响[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(6): 35-41.
[10]	宫楠, 祖鑫, 解志军, 朱长红, 李淑娴. 紫荆种子吸胀和层积过程中不同相态水分变化的核磁共振检测[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(6): 42-50.
[11]	王章荣, 季孔庶, 徐立安, 邹秉章, 林能庆, 林景泉. 马尾松实生种子园营建技术、现实增益及多世代低成本经营新模式探讨[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(6): 9-16.
[12]	欧阳, 欧阳芳群, 孙猛, 王超, 王军辉, 安三平, 王丽芳, 许娜, 王猛. 欧洲云杉无性系幼龄生长节律、年度和密度互作效应及选择策略[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(6): 95-104.
[13]	罗芊芊, 李峰卿, 肖德卿, 邓章文, 王建华, 周志春. 两个南方红豆杉天然居群的交配系统分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(5): 80-86.
[14]	郭伟, 韩秀, 张利, 王迎, 杜辉, 燕语, 孙忠奎, 张林, 李国华, 罗磊. 青檀扦插苗对不同氮素水平的形态、光合生理响应和转录组分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(5): 87-96.
[15]	刘蓉, 吴德军, 王因花, 任飞, 李丽, 燕丽萍, 周晓锋. 白蜡花粉最佳离体萌发培养基筛选[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2023, 47(3): 70-76.

利用ISSR和SRAP标记分析油茶遗传多样性

Genetic diversity of Camellia oleifera using ISSR and SRAP markers

PDF

可视化

摘要/Abstract

引用本文

使用本文

参考文献

相关文章 15

编辑推荐

Metrics

本文评价

作者

读者

审稿