miR164a及其靶基因PeNAC1相互作用研究

doi:10.3969/j.issn.1000-2006.2016.05.005

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南京林业大学学报（自然科学版） ›› 2016, Vol. 40 ›› Issue (05): 29-33.doi: 10.3969/j.issn.1000-2006.2016.05.005

miR164a及其靶基因PeNAC1相互作用研究

王浩然,李爽爽,乐丽娜,匡华琳,黄敏仁,陈英^*

南方现代林业协同创新中心,南京林业大学林学院,江苏省农业种质资源保护与利用平台杨树种质资源圃,江苏南京 210037

出版日期:2016-10-18 发布日期:2016-10-18
基金资助:
收稿日期:2015-12-23 修回日期:2016-05-13
基金项目:国家林业公益性行业科研专项青年项目(20134111); 国家自然科学基金青年项目(31200507); 江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)
第一作者:王浩然(njlydxwhr@163.com)。*通信作者:陈英(ychen@ njfu.edu.cn),副教授。
引文格式:王浩然,李爽爽,乐丽娜,等. miR164a及其靶基因PeNAC1相互作用研究[J]. 南京林业大学学报(自然科学版),2016,40(5):29-33.

Interaction between miR164a and its target PeNAC1

WANG Haoran, LI Shuangshuang,LE Lina,KUANG Hualin,HUANG Minren,CHEN Ying^*

Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, College of Forestry, Nanjing Forestry University, Poplar Germplasm Nursery, Jiangsu Provincial Platform for Conservation and Utilizations for Agricultural Germplasm, Nanjing 210037, China

Online:2016-10-18 Published:2016-10-18

摘要/Abstract

摘要： miRNA参与了生物体重要的基因表达调控过程,其中miR164通过对标靶NAC(NAM/ATAF/CUC)基因家族的精细调控,在植物激素信号传导、生长发育以及胁迫应答中起着重要作用。为了验证杨树中miR164a和其预测靶基因PeNAC1间是否也存在这一相互作用,笔者采用PCR技术克隆了毛果杨(Populus trichocarpa)miR164a的前体序列Ptc-MIR164a,并通过RNA fold(http://rna.tbi.univie.ac.at/)在线软件对其进行了miRNA二级结构分析。结果表明:该序列能形成典型的二级茎环结构,预示其在细胞内能被加工为成熟的miR164a。进一步借鉴动物细胞miRNA研究中荧光素酶报告基因法,利用高效的杨树原生质体瞬时表达体系,验证了Ptc-MIR164a对其预测靶基因PeNAC1的标靶作用; 同时,也建立了一种比较简单、直观的植物miRNA靶标基因的鉴定方法。

Abstract: miRNA plays a central role in gene regulations. Many research showed that miR164a targets NAC(NAM/ATAF/CUC)genes involved in multiple biological functions, such as plant development, hormones singal transduction and environmental stimuli. To confirm the interaction between micro164a and its predicted target gene PeNAC1 in poplar, the pre-micro164a sequence was cloned from P. trichocarpa genome DNA by PCR, named Ptc-MIR164a. And according to the results of secondary structure analyses with RNA fold(http://rna.tbi.univie.ac.at/), Ptc-MIR164a can form a typical stem-loop structure that suggests it can be processed into mature miRNA164a in vivo. Then combining the principle of luciferase reporter plasmids used in miRNA target detection in animal cell and the transient expression system of poplar protoplasts, we confirmed the interaction between Ptc-MIR164a and PeNAC1 and established a simple and intuitive method for miRNA target detection in plant cell.

中图分类号:

S722
Q343

王浩然,李爽爽,乐丽娜,等. miR164a及其靶基因PeNAC1相互作用研究[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2016, 40(05): 29-33.

WANG Haoran, LI Shuangshuang,LE Lina,KUANG Hualin,HUANG Minren,CHEN Ying. Interaction between miR164a and its target PeNAC1[J].Journal of Nanjing Forestry University (Natural Science Edition), 2016, 40(05): 29-33.DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.2016.05.005.

参考文献

[1] Reinhart B J, Weinstein E G, Rhoades M W, et al. MicroRNAs in plants[J]. Genes Dev, 2002, 16(13): 1616-1626. Doi:10.1101/gad.1004402.
[2] Chen X. MicroRNA biogenesis and function in plants[J]. FEBS Lett, 2005, 579(26): 5923-5931. Doi:10.1016/j.febslet.2005.07.071.
[3] Jones-Rhoades M W, Bartel D P, Bartel B. MicroRNAS and their regulatory roles in plants[J]. Annu Rev Plant Biol, 2006, 57: 19-53. Doi:10.1146/annurev.arplant.57.032905.105218.
[4] Mallory A C, Vaucheret H. Functions of microRNAs and related small RNAs in plants[J]. Nat Genet, 2006, 38(S): 31-36. Doi:10.1038/ng1791.
[5] Simon S A, Meyers B C. Small RNA-mediated epigenetic modifications in plants[J]. Curr Opin Plant Biol, 2011, 14(2): 148-155. Doi:10.1016/j.pbi.2010.11.007.
[6] Válóczi A, Várallyay E, Kauppinen S, et al. Spatio-temporal accumulation of microRNAs is highly coordinated in developing plant tissues[J]. Plant J, 2006, 47(1): 140-151. Doi:10.1111/j.1365-313X.2006.02766.x.
[7] Guo H S, Xie Q, Fei J F, et al. MicroRNA directs mRNA cleavage of the transcription factor NAC1 to downregulate auxin signals for Arabidopsis lateral root development[J]. Plant Cell, 2005,17:1376-1386. Doi:10.1105/tpc.105.030841.
[8] Mallory A C, Dugas D V, Bartel D P, et al. MicroRNA regulation of NAC-domain targets is required for proper formation and separation of adjacent embryonic, vegetative, and floral organs[J]. Curr Biol, 2004,14: 1035-1046. Doi:10.1016/j.cub.2004.06.022.
[9] Mao W, Li Z, Xia X, et al. A combined approach of high-throughput sequencing and degradome analysis reveals tissue specific expression of microRNAs and their targets in cucumber[J]. PLoS One, 2012,7(3): e33040. Doi:10.1371/journal.pone.0033040.
[10] Lee J Y, Kim S, Hwang D W, et al. Development of a Dual-luciferase reporter system for in vivo visualization of microRNA biogenesis and posttranscriptional regulation[J]. J Nucl Med. 2008, 49(2):285-294. Doi:10.2967/jnumed.107.042507.
[11] Tan B, Xu M, Chen Y, et al. Transient expression for functional gene analysis using Populus protoplasts[J]. Plant Cell Tiss Organ Cult, 2013, 114(1): 11-18. Doi:10.1007/s11240-013-0299-x.
[12] 王浩然,邵志龙,朱燕宇,等. '南林895'杨PdNAC1 基因克隆及蛋白的亚细胞定位[J].南京林业大学学报(自然科学版),2015,39(3):50-54. DOI:10.3969/j.issn.1000-2006.2015.03.010. Wang H R,Shao Z L,Zhu Y Y,et al. Cloning and sub-cellular localization of PdNAC 1 in poplar ‘Nanlin895'[J]. Journal of Nanjing Forestry University(Natural Sciences Edition), 2015,39(3):50-54.
[13] Llave C, Xie Z, Kasschau K D, et al. Cleavage of Scarecrow-like mRNA targets directed by a class of Arabidopsis miRNA[J]. Science, 2002, 297(5589): 2053-2056. Doi:10.1126/science.1076311.
[14] Laufs P, Peaucelle A, Morin H, et al. MicroRNA regulation of the CUC genes is required for boundary size control in Arabidopsis meristems[J]. Development, 2004, 131(17): 4311-4322. Doi:10.1242/dev.01320.
[15] Fang Y, Xie K, Xiong L. Conserved miR164-targeted NAC genes negatively regulate drought resistance in rice[J]. J Exp Bot, 2014, 65(8): 2119-2135. Doi:10.1093/jxb/eru072.
[16] 曹学武, 陈正堂. miRNA靶基因实验验证的研究进展[J]. 重庆医学, 2009, 38(2): 211-213. Doi:10.3969/j.issn.1671-8348.2009.02.047.

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[1]	许慧慧, 班卓, 王晨雪, 毕泉鑫, 刘肖娟, 王利兵. 文冠果BZR1基因家族鉴定及功能分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2025, 49(2): 12-22.
[2]	戚亚, 王改萍, 轩辕欣彤, 彭大庆, 李硕民, 李守科, 曹福亮. 文冠果药用优良无性系评价[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2025, 49(2): 38-44.
[3]	陈升侃, 郭东强, 邓紫宇, 唐庆兰, 廖长琨, 杨植旺, 朱原立, 李昌荣. 斑皮柠檬桉种源树高生长稳定性评价[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2025, 49(2): 67-74.
[4]	姚俊修, 任飞, 王因花, 李庆华, 燕丽萍, 郑岩, 吴德军. 基于荧光SSR标记的接骨木种质资源遗传多样性分析[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2025, 49(2): 75-82.
[5]	柯欣, 费琪, 夏馨蕊, 叶建仁, 朱丽华. 抗松针褐斑病湿地松胚性愈伤组织诱导及体胚产量影响因素的研究[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2025, 49(1): 87-94.
[6]	林强, 徐进, 李上前, 林云斌, 章允清, 欧阳磊. 福建福鼎柳杉种子园半同胞子代遗传变异分析与早期选择[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2025, 49(1): 78-86.
[7]	姜波, 安新民. 基因组精准编辑技术及其在林木育种中的应用[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2025, 49(1): 11-20.
[8]	张伟溪, 丁密, 苏晓华, 李爱平, 王小江, 余金金, 李政宏, 黄秦军, 丁昌俊. 小叶杨×欧洲黑杨杂交F₁代生长及叶片解剖结构杂种优势分析与抗旱性评价[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2025, 49(1): 46-58.
[9]	杨袁木, 李娜, 陈新宇, 徐放, 潘文, 张卫华. 红锥种源与无性系的材性变异研究[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(6): 41-50.
[10]	闫平玉, 张磊, 王佳兴, 冯可乐, 王浩浩, 张含国. 红松天然种群遗传多样性分析及核心种质构建[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(5): 69-80.
[11]	王佳兴, 闫平玉, 孙佰飞, 刘劲宏, 冯可乐, 张含国. 长白落叶松自由授粉家系生长变异及优良家系早期选择[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(5): 81-89.
[12]	匡泽宇, 彭冶, 方炎明. 铁冬青花挥发性化合物对中华蜜蜂访花的影响[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(4): 254-260.
[13]	刘莉, 瞿印权, 余延浩, 王倩, 洑香香. 青钱柳全基因组SSR位点分析及多态性引物开发[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(4): 67-75.
[14]	刘夏岚, 宋子琪, 胡凤荣, 尚旭岚. 青钱柳二倍体和四倍体叶特征比较研究[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(4): 76-84.
[15]	马坛, 田野, 王书军, 李文昊, 段启英, 张庆源. 不同性别南方型黑杨无性系叶片对土壤短期间歇性干旱的生理响应[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2024, 48(3): 172-180.

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