异速生长的QTL定位模型及一因多效性扩展

doi:10.3969/j.issn.1000-2006.2014.03.007

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南京林业大学学报（自然科学版） ›› 2014, Vol. 38 ›› Issue (03): 35-39.doi: 10.3969/j.issn.1000-2006.2014.03.007

异速生长的QTL定位模型及一因多效性扩展

李婕¹,王忠^2*,李永慈^3*,盖钧镒⁴,黄中文⁵,邬荣领²

1.北京林业大学林学院,北京 100083;
2.北京林业大学生物学院,北京 100083;
3.北京林业大学理学院, 北京 100083;
4.南京农业大学农学院,江苏南京 210095;
5.河南科技学院农学系,河南新乡 453003

出版日期:2014-05-15 发布日期:2014-05-15
基金资助:
收稿日期:2013-11-28 修回日期:2014-02-21
基金项目:中央高校基本科研业务费专项项目(BLX2013026)
第一作者:李婕,硕士生。*通信作者:王忠,副教授。E-mail: wzhy2000@hotmail.com。李永慈,副教授。E-mail:lyczs@126.com。
引文格式:李婕,王忠,李永慈,等. 异速生长的QTL定位模型及一因多效性扩展[J]. 南京林业大学学报:自然科学版,2014,38(3):35-39.

A novel QTL mapping model for allometric growth and pleiotropic extension

LI Jie¹,WANG Zhong^2*,LI Yongci^3*,GAI Junyi⁴,HUANG Zhongwen⁵,WU Rongling²

1. College of Forestry,Beijing Forestry University,Beijing 100083,China;
2. College of Biology,Beijing Forestry University,Beijing 100083, China;
3. College of Science,Beijing Forestry University,Beijing 100083,China;
4.College of Agronomy,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China;
5. Department of Agronomy,Henan Institute of Science and Technology,Xinxiang 453003,China

Online:2014-05-15 Published:2014-05-15

摘要/Abstract

摘要： 异速生长是生物界被广泛研究的一个重要生长规律。为了揭示异速生长相关的QTL及一因多效性,考虑了生物生长过程的动态特性,并基于功能作图的框架,构造了一个解析异速生长关系的QTL定位模型。使用这个模型,对一个大豆重组自交系群体(RIL)的叶片生物量和总生物量的异速生长关系进行了分析,并在第24号连锁群上检测到一个影响这一异速生长关系的QTL,同时使用Logistic生长曲线,在此QTL区间内检测到了影响叶片动态生长的QTL。模拟实验结果发现,通过该算法可提高QTL定位的准确性,也能评估异速生长的生长指数等参数。

Abstract: Allometric growth has been widely studied as an important law in biology. In order to reveal allometric growth and its pleiotropism, a new model is proposed to map the QTL which is related to allometric growth based on the framework of functional mapping in this paper. Using this model, a soybean population of recombinant inbred lines(RIL)is demonstrated to analyze the QTLs which affect allometric growth between leaf biomass and total weight. The QTLs in the 24th linkage groups detected by this model are testified by the Logistic model to find out pleiotropism. This extended model improves the accuracy of QTL mapping and estimate of the parameters of allometric growth by means of two merits, which the dynamic traits of biological growth processes are conceived and multiple time points in the experimental data are employed.

中图分类号:

S722

李婕,王忠,李永慈,等. 异速生长的QTL定位模型及一因多效性扩展[J]. 南京林业大学学报（自然科学版）, 2014, 38(03): 35-39.

LI Jie,WANG Zhong,LI Yongci,GAI Junyi,HUANG Zhongwen,WU Rongling. A novel QTL mapping model for allometric growth and pleiotropic extension[J].Journal of Nanjing Forestry University (Natural Science Edition), 2014, 38(03): 35-39.DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.2014.03.007.

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